在固定总价承包合同履行过程中，若工程发生变更，结算方式需细致且全面地考虑合同约定、相关法律法规以及实际施工情况。以下是对此问题的详细解答：
一、合同约定优先原则
有明确约定的情况：
- 若合同中已明确规定了设计变更的处理程序、费用计算方法及工期调整规则，那么双方应严格按照这些约定来执行。这涵盖了设计变更的提出、审批流程，以及针对不同类型设计变更的费用和工期调整的具体方式。
无约定或约定不明的情况：
- 当合同未对设计变更作出明确规定时，双方可首先尝试参照合同中的其他相关条款或标准，对工程量增减部分进行单独结算。
- 若无法参照合同中的约定标准，则应参照施工地建设行政主管部门发布的计价方法或计价标准来进行结算。
二、费用与工期的具体调整
费用调整：
- 对于因设计变更而增加或减少的工程项目，若能适用原合同中的单价，则按原合同单价来计算费用。
- 对于新产生的工程项目，承包人应提出适当的变更价格，并经发包人确认后执行。在确定价格时，可以参考市场计价依据，确保价格的合理性和公平性。
- 还需考虑价格波动因素。如因设计变更导致材料价格、人工费用等大幅上涨，双方应根据公平原则合理分担风险，避免单方面承担过大的经济压力。
工期调整：
- 需要分析设计变更是否影响了工程的关键线路。如果设计变更导致关键工作的持续时间增加，那么应相应延长工期。
- 根据设计变更的具体内容和工程实际情况，计算合理的工期延长天数，确保工程能够按时、按质完成。
三、举证责任与法律依据
举证责任：
- 主张工程价款调整的当事人，需要对合同约定施工的具体范围、实际工程量增减的原因、数量等事实承担举证责任。
- 为了支持自己的主张，当事人应提供工程设计变更通知、工程联系单、签证文件等相关证据，以证明设计变更的存在以及其对工程价款和工期的影响。
法律依据：
- 根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》的规定，如果双方对计价标准或方法有约定，那么应按照约定进行结算；如果无约定且不能协商一致，则应参照当地建设行政主管部门发布的计价方法或标准进行结算。
四、实践建议与争议解决
实践建议：
- 在签订合同时，应明确施工范围，并详细列明固定总价所包含的风险，以减少后续争议的可能性。
- 提前在合同中约定设计变更的处理方式，并在变更发生时及时签订补充协议，明确变更内容、费用和工期等关键事项。
- 保留好与工程变更相关的所有文件和记录，包括变更通知、签证文件、施工图纸等，以备不时之需。
争议解决：
- 当双方在设计变更的结算问题上产生争议时，应首先积极协商，沟通变更内容、费用和工期等问题，寻求双方都能接受的解决方案。
- 如果协商不成，可以选择调解、仲裁或诉讼等方式来解决争议。可以邀请中立的第三方进行调解，或者根据合同中的仲裁条款申请仲裁，或者向有管辖权的人民法院提起诉讼。
综上所述，固定总价承包合同变更后的工程结算是一个复杂而细致的过程，需要双方严格遵循合同约定，并在无约定或约定不明时参照相关法律法规及计价标准进行。同时，双方应保留充分证据以备争议解决，并积极通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式来解决争议。