综合工时并非单纯指实际上班工时，且年假和法定节假日的工时在计算综合工时制时通常需要剔除或特殊处理。以下是对这一问题的详细解释：
综合工时制的定义
综合工时制，即综合计算工时工作制，是指用人单位因工作情况特殊或受季节和自然条件限制，需安排职工连续作业，无法实行标准工时制，而采用以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。其核心在于“综合计算”，而非简单地记录每日的实际工作时间。
综合工时制的计算方式
周期内的总工时：在综合计算周期内（如周、月、季、年），劳动者的总实际工作时间不得超过总法定标准工作时间。例如，若以月为周期，则月总工时不得超过166.64小时（法定月工作日20.83天乘以每日8小时）。
加班工时的认定：
- 延长工作时间：在综合计算周期内，若总实际工作时间超过总法定标准工作时间，超出部分视为延长工作时间，应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付工资报酬。
- 法定节假日工作：若劳动者在法定节假日工作，无论总实际工作时间是否超过总法定标准工作时间，均应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付工资报酬，且这部分时间不计入综合计算周期内的总工时。
年假的处理：年假是劳动者的休息休假权利，不属于工作时间范畴。因此，在计算综合工时制时，年假的工时通常不计入总实际工作时间。劳动者在年假期间享受正常的工资待遇，且这部分时间不影响综合计算周期内的工时计算。
实际应用中的注意事项
- 合同约定：用人单位与劳动者在签订劳动合同时，应明确约定采用综合工时制，并明确综合计算周期、工时计算方法、加班工资支付等条款。
- 审批备案：实行综合工时制需经劳动行政部门审批备案，未经审批擅自实行的，可能面临法律风险。
- 工时记录：用人单位应建立完善的工时记录制度，准确记录劳动者的实际工作时间和加班情况，以便在发生争议时提供证据。
举例说明
假设某用人单位以月为周期实行综合工时制，某劳动者在一个月内实际工作了180小时，其中包含了4天的法定节假日工作（每天8小时）和5天的年假（每天8小时）。在计算综合工时时：
- 法定节假日工时：4天×8小时/天=32小时，这部分时间不计入综合计算周期内的总工时，但应支付300%的工资报酬。
- 年假工时：5天×8小时/天=40小时，这部分时间同样不计入综合计算周期内的总工时，且劳动者在年假期间享受正常工资待遇。
- 实际计入综合工时的工时：180小时-32小时（法定节假日）-40小时（年假）=108小时。由于108小时未超过月法定标准工作时间166.64小时，因此不视为延长工作时间，无需支付加班工资。但若超过166.64小时，则超出部分应支付150%的加班工资。
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