串标围标行为在第三年被查出，行为人仍可能面临行政处罚、刑事处罚以及民事赔偿责任，具体处理方式需结合行为性质、情节严重程度及法律规定综合判断。以下从不同法律后果角度展开分析：
一、行政处罚：时效限制下仍可能被追责
根据《行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚（涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，追责期限延长至五年）。串标围标行为通常属于普通违法行为，若第三年才被发现，需重点审查：
- 违法行为发生时间：若行为发生在两年内（如多次串标中最后一次行为在两年内），行政机关仍可处罚；
- 违法行为连续性：若串标行为呈持续状态（如长期通过固定几家企业围标），则从行为终了之日起计算追责期限，第三年发现仍可能处罚；
- 处罚类型：可能包括罚款（如中标项目金额千分之五至千分之十）、没收违法所得、取消投标资格（一至三年内禁止参加政府采购活动）等。
二、刑事处罚：不受追诉时效限制的关键情形
若串标围标行为构成犯罪（如《刑法》第二百二十三条规定的串通投标罪），则需关注刑事追诉时效：
- 法定最高刑为不满五年有期徒刑的，追诉时效为五年；串通投标罪最高刑为三年有期徒刑，因此第三年发现仍可追诉；
- 情节特别严重（如造成国家直接经济损失数额巨大、中标项目金额特别巨大等），可能面临三年以上七年以下有期徒刑，追诉时效延长至十年；
- 刑事处罚后果：除有期徒刑外，还可能并处罚金（如对单位判处罚金，对直接责任人员处项目金额千分之一至千分之五罚金）。
三、民事赔偿：合同效力与损失承担
串标围标行为可能导致中标合同无效（《民法典》第一百五十四条），此时需处理：
- 合同无效后果：因行为人恶意串通损害国家、集体或第三人利益，合同自始无效，已履行的需恢复原状（如返还已支付的工程款）；
- 损失赔偿：若因串标导致其他投标人损失（如投标费用、预期利益等），行为人需承担连带赔偿责任；
- 举证责任：受害方需证明行为人存在串标行为及自身损失与行为的因果关系，实践中可通过招标文件、投标记录、证人证言等证据佐证。
四、实务建议：主动应对与合规整改
若面临此类调查，建议：
- 配合调查：及时提交相关材料（如投标文件、合同、沟通记录等），避免因抗拒调查加重处罚；
- 法律评估：委托律师分析行为性质（如是否构成犯罪、情节轻重），制定应对策略；
- 合规整改：完善企业招投标制度（如建立内部审查机制、加强员工培训），避免再次涉险。
提示：串标围标行为法律后果严重，且行政、刑事、民事责任可能并行。若您或企业涉及此类问题，可直接向我咨询具体应对方案，我将结合证据材料提供专业分析。