核心结论：在试用期发生工伤且在治疗期间试用期结束的情况下，您可以先与单位明确工伤认定及待遇情况，再基于自身康复状况和单位协商签订转正合同，协商时要注意保留相关证据、明确合同条款。以下是具体分析：
- 明确工伤认定及待遇情况
- 首先，要确认您的工伤是否已经进行了认定。根据《工伤保险条例》，职工发生事故伤害，所在单位应当自事故伤害发生之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。如果单位未按规定申请，您或者您的近亲属、工会组织在事故伤害发生之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
- 在工伤认定结果出来后，您有权享受相应的工伤保险待遇，包括医疗费用报销、停工留薪期工资等。在和单位协商签订转正合同前，要确保单位已经按照规定为您申报了工伤，并且您能够正常享受这些待遇。如果单位存在拖延或者拒绝申报工伤的情况，您可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 基于自身康复状况协商
- 如果您的工伤已经基本康复，不影响正常工作，那么在和单位协商签订转正合同时，您可以强调自己在试用期内的工作表现和能力，表达自己希望继续留在单位工作的意愿。同时，也可以了解一下单位对于转正的标准和要求，看看自己是否已经达到。
- 如果您的工伤还未完全康复，可能还需要一段时间的治疗和休养，那么在协商时，您可以和单位说明自己的实际情况，提出合理的诉求。例如，希望单位能够给予一定的宽限期，在您完全康复后再正式签订转正合同；或者希望在停工留薪期结束后，能够根据您的身体状况安排合适的工作岗位。
- 协商过程中的注意事项
- 保留相关证据：在和单位协商的过程中，要注意保留好相关的证据，如工伤认定书、医疗诊断证明、与单位沟通的记录等。这些证据在后续可能发生的纠纷中会起到重要的作用。
- 明确合同条款：在签订转正合同时，要仔细阅读合同条款，确保合同中明确约定了您的工作岗位、工作内容、工资待遇、工作时间、社会保险等重要事项。如果对合同条款有疑问或者不满意的地方，要及时和单位沟通协商，进行修改和完善。
- 协商方式：协商时尽量采用书面形式，如邮件、信函等，以便留下证据。如果条件允许，也可以邀请工会或者第三方机构参与协商，增加协商的公正性和有效性。
如果在协商过程中遇到困难或者纠纷，您可以随时向我咨询，我会根据具体情况为您提供详细的法律建议和解决方案。