在甲方指定分包的情况下，工程款的支付责任通常取决于分包合同的签订主体及合同条款的具体约定，一般有以下两种情况：
若分包合同由甲方与分包方直接签订：
- 在这种情况下，甲方作为合同的一方，直接承担向分包方支付工程款的义务。这是基于合同相对性原则，即合同只对签订合同的双方产生法律约束力。因此，分包方有权依据合同条款，直接向甲方主张工程款。
若分包合同由总承包方与分包方签订，但分包方由甲方指定：
- 这种情况下，虽然分包方是由甲方指定的，但分包合同的签订主体是总承包方和分包方。根据合同相对性原则，总承包方作为合同的一方，应承担向分包方支付工程款的义务。然而，如果甲方与总承包方在总承包合同中明确约定，甲方对指定分包方的工程款有支付或监管责任，或者甲方实际参与了分包合同的履行（如直接向分包方支付部分款项），那么甲方也可能需要承担一定的支付责任或连带责任。这取决于总承包合同和分包合同的具体条款，以及甲方的实际行为。
法律建议与风险提示：
- 明确合同条款：在签订分包合同时，应明确约定工程款的支付主体、支付方式、支付时间等关键条款，以避免后续纠纷。如果甲方指定分包方，建议在总承包合同和分包合同中均明确甲方的角色和责任，特别是关于工程款支付的部分。
- 保留证据：在合同履行过程中，各方应妥善保留与工程款支付相关的证据，如付款凭证、发票、验收报告等，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
- 及时沟通协商：如果发生工程款支付纠纷，各方应首先尝试通过沟通协商解决问题。如果协商不成，可以考虑通过法律途径解决，如申请仲裁或提起诉讼。
可能涉及的法律后果：
- 如果甲方未按照合同约定支付工程款，分包方有权依据合同条款向甲方主张违约责任，包括要求支付工程款、利息、违约金等。
- 如果总承包方未按照合同约定向分包方支付工程款，分包方同样有权向总承包方主张违约责任。同时，如果甲方在总承包合同中承担了支付或监管责任，分包方也可能有权向甲方主张相应的权利。
总结来说，甲方指定分包工程款的支付责任并非一成不变，而是取决于分包合同的签订主体及合同条款的具体约定。因此，在签订合同时，各方应明确约定工程款的支付责任，并在合同履行过程中保留好相关证据，以便在发生纠纷时能够维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。