教师工伤休假期间的工作量，在年终总工作量考核中通常应当予以扣除。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律角度
工伤待遇原则：
- 根据《工伤保险条例》等相关法律法规，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这意味着，工伤休假期间，教师不应因休假而承担额外的工作量考核压力。
工作量考核的合理性：
- 工作量考核通常是为了评估员工在一定时期内的工作成果和效率。然而，在工伤休假期间，教师因伤无法正常工作，将其休假期间的工作量纳入年终总工作量考核，显然违背了公平、合理的原则。
二、实践角度
学校规章制度：
- 学校作为用人单位，应当制定合理、人性化的规章制度，明确工伤休假期间的工作量考核处理方式。一般来说，学校会遵循法律法规的规定，将工伤休假期间的工作量从年终总工作量中扣除，以保障教师的合法权益。
实际操作中的处理：
- 在实际操作中，如果学校未将工伤休假期间的工作量从年终总工作量中扣除，教师有权向学校提出异议，并要求学校进行更正。如果学校拒绝更正，教师可以通过劳动争议调解、仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。
三、建议与注意事项
保留证据：
- 教师在工伤休假期间，应妥善保留相关医疗证明、休假证明等证据材料，以便在需要时证明自己的休假情况和无法工作的事实。
与学校沟通：
- 如果教师对学校的工作量考核方式有异议，应及时与学校进行沟通，明确表达自己的诉求和理由，争取学校的理解和支持。
寻求法律援助：
- 如果学校拒绝更正工作量考核方式，或者教师在维护自己权益过程中遇到困难，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以获取更专业的法律建议和帮助。
综上所述，从法律和实践的角度来看，教师工伤休假期间的工作量在年终总工作量考核中应当予以扣除。如果学校未按照此原则处理，教师有权提出异议并维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。