结论前置：工作期间发生交通事故公司停职后是否还有工资，需根据您在事故中的责任、受伤情况以及公司的规章制度和劳动合同约定来综合判断。以下是具体分析：
若您在交通事故中不承担主要责任且被认定为工伤：
- 工伤认定：根据《工伤保险条例》第十四条，员工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害，或在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故伤害，应当认定为工伤。因此，若您在工作期间因工作原因外出发生交通事故，或上下班途中发生非本人主要责任的交通事故，均可申请工伤认定。
- 停工留薪待遇：在工伤治疗期间，您享受停工留薪待遇。这意味着，停工留薪期内，您的原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这一期限一般不超过12个月，伤情严重或情况特殊的，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认后，可适当延长，但延长期限也不得超过12个月。
- 伤残待遇与医疗待遇：若您评定伤残等级后，将停发原待遇，转而按照有关规定享受伤残待遇。若停工留薪期满后仍需治疗，您将继续享受工伤医疗待遇。
若您在交通事故中承担主要责任及以上：
- 非工伤处理：若您在交通事故中承担主要责任或全部责任，则不能认定为工伤。此时，公司是否发放工资需依据公司的具体规章制度以及与您签订的劳动合同约定来确定。
- 病假工资：如果您因受伤需要请假就医或休养，并按照公司规定请病假，公司通常会按照病假工资的标准支付工资。一般来说，病假工资不得低于当地最低工资标准的80%。
- 旷工处理：如果您未履行正规请假手续而缺勤，可能会被认定为旷工。在这种情况下，公司可能不发放旷工期间的工资。
特殊情况说明：
- 若您在交通事故中未受伤，则应正常上班，公司也将按照常规标准支付工资。
- 若公司停职决定缺乏合理依据，如未按照公司规章制度或劳动合同约定进行，您有权向公司提出异议，并要求公司恢复您的职位和支付相应工资。若公司拒绝，您可考虑通过劳动仲裁等法律途径维护自己的合法权益。
法律建议：
- 首先，建议您尽快了解自己在交通事故中的责任划分，并收集相关证据，如交通事故责任认定书等。
- 其次，根据责任划分和受伤情况，及时向公司提出工伤认定申请（如符合工伤条件），或按照公司规章制度和劳动合同约定处理工资问题。
- 若公司停职决定不合理或拒绝支付工资，您可与公司协商解决；协商无果的，可向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 若您被认定为工伤且享受停工留薪待遇，公司将依法支付您停工留薪期内的工资福利待遇。
- 若您未被认定为工伤且公司规章制度或劳动合同约定不支付停职期间工资，您可能面临工资损失的风险。但在此情况下，您仍有权要求公司按照病假工资标准支付工资（如符合病假条件）。
- 若公司停职决定缺乏合理依据且拒绝支付工资，您通过法律途径维权成功后，公司将可能面临支付工资、赔偿损失等法律责任。
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