结论：针对您提出的问题，若离婚协议书中已明确注明房子归女方所有，但男方不配合签字，女方可以通过法律途径起诉要求男方履行协议或确认协议效力，进而办理房产过户手续。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律背景与依据
离婚协议的法律效力：
- 离婚协议是夫妻双方在离婚过程中，就财产分割、子女抚养等问题达成的书面协议。一旦双方签字并办理离婚登记手续，该协议即具有法律效力，对双方均具有约束力。
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，离婚协议中关于财产分割的条款或者当事人因离婚就财产分割达成的协议，对男女双方具有法律约束力。
房产过户的法律依据：
- 房产过户是房产所有权转移的重要环节，需要依据相关法律法规进行。在离婚协议中明确房产归属后，双方应按照协议约定办理房产过户手续。
- 若一方不配合办理过户手续，另一方可以通过法律途径要求对方履行协议或确认协议效力，进而办理过户。
二、法律建议与操作步骤
收集证据：
- 女方应收集离婚协议书、离婚证、房产证等相关证据，以证明房产已协议归女方所有，且双方已办理离婚登记手续。
起诉要求履行协议或确认协议效力：
- 女方可以向法院提起诉讼，要求男方履行离婚协议中的房产过户义务，或者确认离婚协议中关于房产分割的条款有效。
- 在诉讼过程中，女方需要提交相关证据，证明离婚协议的真实性、合法性以及男方不配合过户的事实。
法院判决与执行：
- 若法院认定离婚协议有效，且男方应履行过户义务，法院将判决男方在一定期限内配合女方办理房产过户手续。
- 若男方仍不履行判决，女方可以申请法院强制执行，通过法律手段强制男方履行过户义务。
三、可能遇到的法律后果与应对策略
男方提出异议：
- 若男方在诉讼过程中提出异议，如认为离婚协议存在欺诈、胁迫等情形，法院将进行审查。若异议成立，法院可能撤销或变更离婚协议中的相关条款。
- 应对策略：女方应积极应对男方的异议，提供相反证据证明离婚协议的真实性、合法性，以及双方自愿签订协议的事实。
房产存在其他纠纷：
- 若房产存在其他纠纷，如抵押、查封等，可能导致过户手续无法办理。
- 应对策略：女方应提前了解房产状况，若存在纠纷，应与男方协商解决或通过法律途径解决纠纷后，再办理过户手续。
四、实际操作中的注意事项
保持冷静与理性：
- 在处理此类纠纷时，双方应保持冷静与理性，避免情绪化行为导致纠纷升级。
寻求专业法律帮助：
- 由于离婚房产纠纷涉及法律条款较多且复杂，建议女方在处理过程中寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到充分保障。
作为石镇宾律师，我专注于离婚领域，具备丰富的实践经验和专业知识。若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。