结论：公司试用期未签合同，两年后一般不可以再申请劳动仲裁主张未签合同的双倍工资差额，但可能存在例外情况。以下为详细分析：
一、一般情况：超过仲裁时效，无法再申请仲裁
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。在劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受该一年仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
对于公司试用期未签合同的情况，劳动者自入职之日起就应当知道公司未与其签订劳动合同，即其权利被侵害。因此，劳动者应当自入职之日起一年内申请劳动仲裁，主张公司支付未签合同的双倍工资差额。如果超过这个时效期间，劳动者再申请仲裁，仲裁机构将不予受理。
二、例外情况：存在时效中断或中止的情形
虽然一般情况下超过仲裁时效就无法再申请仲裁，但也存在一些例外情况，即仲裁时效中断或中止。
仲裁时效中断：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条第二款的规定，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。因此，如果劳动者在一年内曾经向公司主张过签订劳动合同或支付双倍工资差额的权利，或者向有关部门请求过权利救济，或者公司同意履行签订劳动合同或支付双倍工资差额的义务，那么仲裁时效将中断，并重新计算一年。
仲裁时效中止：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条第三款的规定，因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在本条第一款规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。因此，如果劳动者因为不可抗力（如自然灾害、战争等）或者有其他正当理由（如严重疾病、意外事件等）无法在一年内申请仲裁，那么仲裁时效将中止，并在中止原因消除后继续计算。
三、建议
及时主张权利：如果劳动者发现公司试用期未签合同，应当及时向公司主张签订劳动合同或支付双倍工资差额的权利，并保留好相关证据（如聊天记录、邮件、录音等）。
咨询专业律师：如果劳动者对仲裁时效、仲裁程序等法律问题存在疑问，或者需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。我可以根据劳动者的具体情况，提供更详细、更专业的法律意见。
注意证据收集：无论劳动者是否决定申请仲裁，都应当注意收集与劳动关系相关的证据（如工作证、工资条、考勤记录等），以备不时之需。这些证据在后续的法律程序中可能起到关键作用。