追回工资时，一般是按照应发工资来计算的，但在实际操作中，也需结合具体情况和证据来确定。以下是对这一问题的详细分析：
一、应发工资与实发工资的定义及区别
应发工资：指的是劳动者在正常劳动情况下，用人单位应当支付给劳动者的全部工资报酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等各项收入。它反映了劳动者应得的劳动报酬总额。
实发工资：则是劳动者实际收到的工资，它可能因各种原因（如社保、公积金、个人所得税等扣除项）而少于应发工资。实发工资是劳动者最终到手的金额。
二、追回工资的计算依据
在追回工资的纠纷中，通常是以应发工资作为计算基础的。这是因为：
法律保障：根据《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，用人单位应当按照劳动合同约定的工资标准支付劳动者工资，不得克扣或者无故拖欠。这里的“工资标准”通常指的是应发工资。
公平原则：应发工资反映了劳动者应得的全部劳动报酬，以应发工资为计算基础，能够更公平地保障劳动者的权益。如果以实发工资为计算基础，可能会因扣除项的存在而导致劳动者实际追回的工资少于其应得的报酬。
三、实际操作中的注意事项
证据收集：在追回工资的过程中，劳动者需要收集相关证据来证明自己的应发工资标准，如劳动合同、工资条、银行转账记录等。这些证据将有助于确定追回工资的金额。
扣除项的处理：虽然追回工资通常以应发工资为计算基础，但在实际操作中，也需要考虑扣除项的问题。如果用人单位能够证明某些扣除项是合法且合理的（如社保、公积金等），那么这些扣除项可能会在计算追回工资时被扣除。然而，如果扣除项不合法或不合理，劳动者有权要求用人单位全额支付应发工资。
协商与诉讼：在追回工资的过程中，劳动者可以与用人单位进行协商，尝试达成和解协议。如果协商无果，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
四、特殊情况下的处理
在某些特殊情况下，如用人单位未与劳动者签订劳动合同或劳动合同中未明确约定工资标准时，追回工资的计算可能会更加复杂。此时，劳动者可以参考同行业同岗位的平均工资水平、用人单位的实际支付情况等因素来确定自己的应发工资标准，并据此进行追回。
总结来说，追回工资时一般是以应发工资为计算基础的，但具体金额还需结合实际情况和证据来确定。如果你在追回工资的过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。