当食品中的蛋白质含量不符合其执行标准的理化要求时，这确实是一个涉及食品安全与消费者权益保护的重要问题。针对此类情况，处罚的依据主要来源于《中华人民共和国食品安全法》及其相关实施细则，以下是对此问题的详细解答：
一、主要法律依据
《中华人民共和国食品安全法》是规范食品生产经营活动、保障公众身体健康和生命安全的核心法律。该法明确规定了食品生产经营者应确保其产品符合食品安全标准，包括理化指标如蛋白质含量等。当食品不符合这些标准时，将依法受到处罚。
二、具体处罚措施
没收违法所得与违法物品：
- 监管部门将对违法生产经营的食品、食品添加剂以及用于违法生产经营的工具、设备、原料等物品进行没收。
- 同时，没收违法所得，即扣除成本后通过违法行为所获得的利润。
罚款：
- 罚款金额根据违法行为的严重程度分档设定。对于货值金额不足一万元的，通常处五万元以上十万元以下罚款；货值金额一万元以上的，则处货值金额十倍以上二十倍以下罚款。
- 若食品中的蛋白质含量不符合标准且情节严重（如导致消费者健康受损），罚款力度可能会进一步加大。
吊销许可证：
- 对于情节特别严重的违法行为，如多次违规或造成严重后果的，监管部门有权吊销企业的食品生产经营许可证，即取消其食品生产经营资格。
刑事责任追究：
- 若违法行为构成犯罪，如生产销售不符合安全标准的食品罪，将依法追究刑事责任。这可能包括有期徒刑、拘役、罚金等刑罚。
三、消费者权益保护与赔偿
除了对违法生产经营者的处罚外，消费者也有权根据《中华人民共和国食品安全法》和《中华人民共和国消费者权益保护法》等相关法律规定，要求生产者或经营者进行赔偿。赔偿范围包括人身损害赔偿、食品安全问题赔偿以及最低赔偿额保障。具体来说：
- 人身损害赔偿：若因食用不符合标准的食品导致健康受损，消费者可要求赔偿医疗费、护理费、交通费等实际损失。
- 食品安全问题赔偿：即使未造成人身损害，消费者也有权要求退还食品价款，并要求支付价款十倍或损失三倍的赔偿金（增加赔偿金额不足一千元的，按一千元计算）。
四、建议与注意事项
- 仔细查看食品信息：消费者在购买食品时，应仔细检查标签、说明书等信息，确保食品符合其执行标准。
- 保留相关证据：如发现食品问题，应及时保留购物小票、食品包装等证据，以便在需要时维权。
- 合理提出赔偿要求：根据法律规定合理提出赔偿要求，避免过度索赔或无理取闹。
综上所述，当食品中的蛋白质含量不符合其执行标准的理化要求时，将依法对违法生产经营者进行处罚，并保障消费者的合法权益。消费者应了解自己的权益和维权途径，以便在遇到问题时能够及时有效地维护自身权益。