社区发违建告知函，其合法性需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从多个角度为您详细分析：
一、合法情形
如果社区（或相关有权部门，如规划部门、城管部门等）在发出违建告知函时，遵循了法定程序，且告知函内容准确无误，那么该告知函是合法的。具体来说，合法情形通常包括：
- 主体合法：作出告知函的主体具有法定的职权，如规划部门、城管部门等有权机关。
- 事实认定清楚：告知函中对“违章建筑”的描述准确，清晰说明了认定的具体事实，如建筑的面积、位置等关键信息无误。
- 法律适用正确：引用的法律法规条文正确且准确，没有将合法建设错误地套用到禁止性规定中，或适用已失效的法规条款。
- 程序合法：依法进行了调查取证，且保障了当事人的陈述、申辩权利。
二、不合法情形及应对措施
如果社区发出的违建告知函存在以下不合法情形，您可以通过相应途径来维护自己的合法权益：
主体不合法：
- 描述：作出告知函的主体没有法定的职权。
- 应对措施：指出告知函主体的不合法性，并提供相关法律法规证明该主体无权作出此类告知。同时，您可以向有权机关提出异议，要求重新审查或撤销该告知函。
事实认定不清：
- 描述：告知函中对“违章建筑”的描述不准确，未清晰说明认定的具体事实。
- 应对措施：提供反证，如建设工程规划许可证、土地使用证等，证明建筑并非违章。同时，指出告知函中的事实认定错误，并要求相关部门重新审查。
法律适用错误：
- 描述：引用的法律法规条文不正确或不准确。
- 应对措施：详细阐述正确的法律法规条文，并指出告知函中法律适用的错误。您可以向相关部门提出书面异议，要求其纠正法律适用错误。
程序违法：
- 描述：未依法进行调查取证，或未保障当事人的陈述、申辩权利。
- 应对措施：指出调查取证的不足，以及未给予当事人陈述和申辩机会的程序违法性。您可以向相关部门提出异议，并要求其重新进行调查取证，保障您的合法权益。
三、具体应对步骤
在确认告知函存在不合法情形后，您可以采取以下具体步骤来维护自身权益：
- 提出异议：在规定期限内，按照法定程序向相关部门提出书面异议，陈述自己的观点和理由，要求重新审查或撤销告知函。异议内容应详实、有理有据，附上相关法律法规和证据支持。
- 申请行政复议：如果异议未被接受，您可以在法定期限内向上一级行政机关或同级人民政府申请行政复议。复议申请应详细阐述告知函不合法的具体理由和证据，要求复议机关撤销该告知函。
- 提起行政诉讼：若行政复议未能解决问题，您还可以在收到复议决定或法定复议期限届满之日起15日内，向有管辖权的人民法院提起行政诉讼。通过司法途径，由法院对告知函的合法性进行最终审查和判定。
四、注意事项
在处理此类问题时，您还需注意以下几点：
- 保持冷静和理性：遵循法律程序，避免采取过激行为。
- 保存证据：务必保存好与建筑相关的各类证据，如建设过程中的材料、文件、与相关部门的沟通记录等。这些证据在后续的异议、复议或诉讼过程中将起到关键作用。
- 积极配合调查：在提出异议和申请复议的同时，也应积极配合相关部门的调查和处理工作。这有助于加快问题的解决进程，并维护您的合法权益。
综上所述，社区发违建告知函的合法性需根据具体情况来判断。如果您认为告知函存在不合法情形，可以通过提出异议、申请行政复议或提起行政诉讼等途径来维护自己的合法权益。在整个过程中，务必保持冷静理性、保存证据并积极配合调查。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。