若两个月内犯的两个行政案件不属于同一案子，通常会被分别处理，但具体处理方式需结合案件性质、情节及法律规定综合判断。以下从不同角度展开分析：
分别立案与调查
行政机关对两个独立案件会分别立案，启动独立的调查程序。例如，若第一次是因扰乱公共秩序被处罚，第二次是因非法经营被查处，两案的违法事实、证据收集、法律依据均不同，行政机关需分别制作《受案登记表》《询问笔录》等材料，确保程序合法。
分别作出处罚决定
根据《行政处罚法》，行政机关需针对每个案件的违法情节、社会危害程度等，独立适用法律条款作出处罚。例如，第一次可能被警告或罚款，第二次若情节严重，可能面临更高额罚款、没收违法所得甚至吊销许可证。需注意，若两案存在关联（如第一次违法行为是第二次的前提），行政机关可能合并考量情节，但处罚决定仍需分别作出。
合并执行的可能性
若两案处罚种类相同（如均为罚款），且行政机关认为合并执行更高效，可依据《行政处罚法》第五十二条“当事人确有经济困难，需要延期或者分期缴纳罚款的，经当事人申请和行政机关批准，可以暂缓或者分期缴纳”，或通过内部协调将罚款合并缴纳。但合并执行需严格遵循法定程序，不得擅自加重处罚。
对个人信用或资质的影响
两案独立处理不意味着影响独立计算。例如，若两次违法行为均涉及特定行业准入（如食品经营），第二次处罚可能导致更严格的资质限制（如吊销许可证）；若涉及个人信用记录（如交通违法），两次处罚均会被记录，可能影响贷款、出行等。
建议：若您或他人涉及此类情况，需重点关注两案的违法事实是否独立、处罚依据是否明确，并保留好两案的《处罚决定书》等材料。若对处罚合法性有疑问（如认为两案应合并处理但未合并），可依法申请行政复议或提起行政诉讼。如有具体案件细节，可直接向我咨询，我会结合案情进一步分析。