结论前置：办理退休时被否认干部身份，若因此引发劳动争议，是可以申请劳动仲裁的。以下从多个角度为你详细分析：

一、干部身份认定与退休的关系

干部身份在退休时往往与退休年龄、退休待遇等密切相关。例如，在一般情况下，女干部的退休年龄可能晚于女工人。如果原本被认定为干部身份，但在办理退休时被否认，可能导致退休年龄提前或退休待遇降低，这无疑会损害劳动者的合法权益。

二、劳动仲裁的适用范围

劳动仲裁是解决劳动争议的一种重要方式，其适用范围广泛，包括但不限于因确认劳动关系发生的争议、因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议、因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议等。在办理退休过程中，因干部身份认定问题引发的争议，本质上属于因社会保险（退休待遇）和劳动关系（身份认定）发生的争议，因此属于劳动仲裁的受理范围。

三、申请劳动仲裁的具体操作

1. 准备证据：在申请劳动仲裁前，你需要收集并整理相关证据，以证明你原本被认定为干部身份，以及因被否认干部身份而遭受的损失。这些证据可能包括但不限于：工作证、档案材料、工资单、社保缴纳记录、单位出具的证明文件等。
2. 提交申请：准备好证据后，你可以向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。申请时，需要填写仲裁申请书，并附上相关证据材料。仲裁申请书应当载明劳动者的姓名、性别、年龄、职业、工作单位和住所，用人单位的名称、住所和法定代表人或者主要负责人的姓名、职务，以及仲裁请求和所根据的事实、理由等。
3. 参与仲裁程序：提交申请后，你需要按照仲裁委员会的通知参与仲裁程序。这包括参加仲裁庭的开庭审理、提供证据、进行辩论等。在仲裁过程中，你需要充分陈述自己的主张和理由，并出示相关证据以支持自己的主张。

四、可能的法律后果

如果仲裁委员会认定你的干部身份应当被确认，并因此支持了你的仲裁请求（如要求单位补发退休待遇差额等），那么单位需要按照仲裁裁决履行相关义务。如果单位不履行仲裁裁决，你还可以向人民法院申请强制执行。

五、其他建议

1. 及时咨询：在办理退休过程中遇到干部身份认定问题时，建议及时咨询专业律师或劳动争议调解机构，以了解自己的权益和可能的救济途径。
2. 保持沟通：与单位保持沟通，尝试通过协商解决问题。如果协商不成，再考虑通过法律途径解决争议。

最后，如果你在办理退休过程中遇到干部身份被否认的问题，并因此引发劳动争议，不要犹豫，直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和帮助。