入职体检报告造假多年后发现，一般情况下难以直接追究造假者的法律责任，但特定情形下可能面临一定后果。以下从不同角度为你详细分析：

从民事法律责任角度

1. 合同效力层面：入职体检报告造假，若该造假行为影响了用人单位对劳动者是否符合录用条件的判断，进而签订了劳动合同。从合同效力角度，这可能构成欺诈。根据《民法典》相关规定，一方以欺诈手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受欺诈方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。不过，用人单位需要在知道或者应当知道撤销事由之日起一年内行使撤销权。多年后才发现，通常已经超过了这一撤销权的行使期限，难以通过撤销合同来追究造假者责任。
2. 损害赔偿层面：如果造假行为给用人单位造成了实际损失，比如因劳动者身体原因无法胜任工作，导致用人单位额外支出培训费用、重新招聘费用等，用人单位理论上可以要求造假者赔偿损失。但在多年后才发现的情况下，要证明损失与造假行为之间的因果关系以及损失的具体数额，会面临较大困难。因为时间跨度长，很多证据可能已经灭失，难以形成完整的证据链来支持赔偿请求。

从行政法律责任角度

体检报告造假可能涉及违反相关行政管理规定。例如，如果体检机构参与造假，可能违反了《医疗机构管理条例》等规定，卫生行政部门可以对体检机构进行行政处罚，如警告、罚款、吊销执业许可证等。但对于造假的劳动者个人，一般没有直接的行政处罚规定。而且多年后才发现，行政机关也难以对当时的违法行为进行调查和处理，因为行政处罚通常有时效限制，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚，涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。

从刑事法律责任角度

如果体检报告造假行为情节严重，构成犯罪的，可能会被追究刑事责任。例如，如果造假行为是为了骗取社会保险待遇等，可能涉嫌诈骗罪。但同样，多年后才发现，要追究刑事责任也面临诸多困难。一方面，刑事诉讼有追诉时效的限制，根据犯罪的法定最高刑不同，追诉时效分别为五年、十年、十五年、二十年等。如果超过了追诉时效，就不再追诉。另一方面，要证明造假行为构成犯罪，需要充分的证据，多年后证据收集难度极大。

建议：如果用人单位发现员工入职体检报告造假，即使多年后才发现，也可以先与员工进行沟通协商，了解情况。如果认为员工的行为给单位造成了损失，可以尝试收集相关证据，看是否能够通过民事诉讼途径主张赔偿，但要做好证据收集困难的准备。如果涉及体检机构造假等问题，可以向卫生行政部门举报。

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