离职后公司仍在申报工资，其行为是否违法需根据具体情况判断。若存在合理补发、财务调整等合法情形，则不违法；若为虚增成本偷逃税款或侵犯个人权益，则属于违法行为。 以下从不同角度详细分析：
一、不违法的情况
合理补发工资或奖金
- 情形说明：若员工离职前有未结算清楚的工资、奖金、提成等劳动报酬，公司在离职后进行补发，并按照规定申报个人所得税，这是合理合法的行为。例如，销售员工在离职前有一笔较大的销售提成未发放，公司在核算清楚后于离职次月发放并申报相应工资薪金所得，此情况不违反法律规定。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。补发工资是履行这一义务的体现。
财务处理或申报调整的特殊需要
- 情形说明：因财务核算周期、税务申报系统要求等客观原因，可能存在时间差或对前期申报数据进行合理调整的需求。如公司在某月份发现上一季度对某离职员工的工资薪金申报有误，需在后续月份进行更正申报。只要这种调整基于真实的业务情况且符合相关规定，就不构成违法。
- 法律依据：税务申报需遵循真实、准确的原则，因客观原因导致的调整，在符合税务部门规定的情况下，是允许的。
二、违法的情况及法律后果
虚增成本偷逃税款
- 情形说明：公司为减少企业所得税应纳税额，通过虚假申报离职员工工资来虚增企业成本费用，此行为违法。
- 法律依据：依据《中华人民共和国税收征收管理法》，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁帐簿、记帐凭证，或在帐簿上多列支出，不缴或少缴应纳税款的，构成偷税。税务机关将追缴税款、滞纳金，并处以罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
- 法律后果：公司可能面临税务部门的处罚，包括补交税款、滞纳金和罚款，甚至可能涉及刑事责任。
侵犯个人权益
- 情形说明：公司未经离职员工同意，利用其身份信息进行不实工资申报，可能对员工个人的税收记录、社保记录产生不良影响，侵犯员工合法权益。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》关于保护个人信息和权益的规定，离职员工有权要求公司停止侵权行为并赔偿损失。
- 法律后果：离职员工可要求公司停止侵权，并可通过法律途径要求公司赔偿因此造成的损失。
违反劳动法及劳动合同法
- 情形说明：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。若公司已为员工办理离职手续并结清工资，但仍在申报该员工工资，则违反了上述法律规定。
- 法律依据：同上述劳动法第五十条及劳动合同法相关规定。
- 法律后果：离职员工可依据相关法律，要求公司支付由此产生的经济损失，并可通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
三、应对措施
- 及时沟通：离职员工应首先与公司沟通，要求其立即停止申报工资并办理相关注销手续。
- 向税务部门说明情况：若公司不予配合，离职员工可向当地税务部门说明情况，并提供相关证据（如离职证明、工资发放记录等）。
- 法律途径维权：若沟通无果，离职员工可通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，离职后公司仍在申报工资的行为是否违法需根据具体情况判断。离职员工应了解自己的权益，采取适当的措施应对可能的违法行为。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。