从业人员拒绝用人单位违章指挥后，用人单位降低其工资的行为是违法的，从业人员有权依法维护自己的合法权益。以下是从多个角度对此问题的详细分析：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国安全生产法》第五十五条：明确规定从业人员有权拒绝违章指挥和强令冒险作业，且生产经营单位不得因此降低其工资、福利等待遇或解除与其订立的劳动合同。这一条款直接保护了从业人员在拒绝违章指挥后的工资福利权益。

2. 《中华人民共和国劳动合同法》第三十二条：也明确指出，劳动者拒绝用人单位管理人员违章指挥、强令冒险作业的，不视为违反劳动合同。这意味着，从业人员拒绝违章指挥是合法的，用人单位不能因此对其进行处罚或降低工资。

3. 《中华人民共和国劳动法》第五十六条：劳动者对用人单位管理人员违章指挥、强令冒险作业，有权拒绝执行。这一条款同样强调了从业人员的拒绝权，并隐含了用人单位不得因此降低工资等不公平待遇的义务。

二、用人单位降低工资的违法性

用人单位在从业人员拒绝违章指挥后降低其工资，不仅违反了上述法律法规，也损害了从业人员的合法权益。这种行为可能构成对劳动合同的违反，从业人员有权要求用人单位恢复原工资待遇，并可能因此获得相应的经济补偿。

三、从业人员的应对措施

1. 明确表达拒绝态度：从业人员应坚定、明确地表达自己的拒绝意愿，告知管理人员其指挥违反了相关安全规定或操作规程，并说明不能按照该指挥进行作业的原因。

2. 及时报告情况：向企业内部的安全生产管理部门、工会或其他相关监督部门报告情况，说明拒绝的理由和依据，以便这些部门能够及时调查和处理。

3. 寻求支持：在必要时，可寻求工会或相关监管部门的支持和帮助，以确保自己的合法权益得到有效维护。例如，可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁。

4. 保留证据：在拒绝违章指挥的过程中，从业人员应保留相关证据，如对话记录、书面指示、工资条等，以备后续可能的纠纷或争议解决之需。这些证据将有助于证明从业人员的拒绝行为是合法的，以及用人单位降低工资的行为是违法的。

四、可能的法律后果

如果用人单位坚持降低从业人员的工资，从业人员有权通过法律途径维护自己的权益。这可能包括向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，从业人员需要提供充分的证据来证明自己的主张，如上述提到的对话记录、书面指示、工资条等。如果仲裁或诉讼结果支持从业人员的诉求，用人单位将需要恢复原工资待遇，并可能因此承担额外的经济赔偿责任。

总结来说，从业人员在面对用人单位的违章指挥时，有权依法拒绝，并且这一权利受到多项法律法规的明确保护。用人单位不得因此降低从业人员的工资福利等待遇。如果用人单位违反了这一规定，从业人员有权通过法律途径维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。