在刑事案件指定管辖后发现新的罪名，通常不影响原指定管辖的效力，原指定机关一般继续管辖新罪名涉及的案件，但存在特殊情形时可能调整管辖。具体分析如下：

1. 一般情形：原指定机关继续管辖
   根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，指定管辖的核心目的是解决案件管辖权争议或确保诉讼顺利进行。若在指定管辖后发现新的罪名，且该罪名与原案件存在关联（如基于同一事实或证据链），通常视为原案件的延伸，原指定机关（如法院、检察院）会继续行使管辖权。例如，被告人因涉嫌诈骗罪被指定至A法院审理，审理中发现其还涉嫌洗钱罪，若两罪基于同一诈骗事实，A法院可一并审理。

2. 特殊情形：可能调整管辖的情况

   • 新罪名与原案件无关联：若新罪名与原案件在事实、证据或法律关系上完全独立（如原案为盗窃，新罪名为故意伤害），原指定机关可能将新罪名移送至有管辖权的机关处理。但实践中，为提高诉讼效率，也可能由原机关合并管辖，需结合具体案情判断。
     
   • 管辖权冲突：若新罪名的管辖权与原指定机关存在冲突（如原为基层法院管辖，新罪名属中级法院管辖），可能根据《刑事诉讼法》第21条调整级别管辖，由上级法院指定或提级审理。
     
   • 程序便利性：若新罪名的加入导致案件复杂度显著增加（如涉及跨国犯罪、重大社会影响），原指定机关可能基于诉讼效率考虑，报请上级机关协调管辖。

3. 实务建议

   • 及时沟通：若您是当事人或辩护人，发现新罪名后应第一时间与办案机关沟通，明确管辖意向，避免程序延误。
     
   • 审查关联性：重点审查新罪名与原案件是否基于同一事实或证据链，若存在关联，可主张由原机关继续管辖；若无关，可申请分案处理。
     
   • 关注程序合法性：若管辖调整可能影响诉讼权利（如审理法院级别变化），可依法提出异议，要求办案机关说明理由并保障程序公正。

总结：指定管辖后发现新罪名，原则上由原机关继续管辖，但需结合罪名关联性、管辖权冲突及程序便利性综合判断。如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合案情提供针对性分析。