针对您提出的“公司加班超过违法导致疾病怎么赔偿”的问题，这是一个涉及劳动法与工伤保险条例的复杂但重要的问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、核心原则：赔偿取决于是否构成工伤
首先，要明确的是，加班导致突发疾病的赔偿问题，关键在于该疾病是否满足工伤认定的条件。如果符合工伤标准，那么赔偿将按照工伤的相关规定来执行；如果不符合，企业可能基于人道主义原则或过错程度给予适当补助，甚至在某些情况下承担民事赔偿责任。
二、工伤情形下的详细赔偿
工伤认定条件：
- 根据《工伤保险条例》第十五条第一项，员工在工作时间和工作岗位上突发疾病，且在48小时之内经抢救无效死亡的，或者虽然未死亡但符合其他工伤认定条件的（如因疾病导致长期丧失劳动能力等，具体需根据地方规定和实际情况判断），应被认定为工伤。
赔偿项目与标准：
- 丧葬补助金：如果员工因加班导致的疾病死亡，企业需支付6个月的统筹地区上年度职工月平均工资作为丧葬补助金。
- 一次性工亡补助金：标准为上一年度全国城镇居民人均可支配收入的20倍，这是针对员工因工死亡的一次性经济补偿。
- 供养亲属抚恤金：如果员工有需要供养的亲属，企业还需按月支付抚恤金，标准根据亲属关系和员工工资比例确定。
- 其他费用：还包括医疗费、住院伙食补助费、外地就医交通费及食宿费、康复治疗费、辅助器具费、停工留薪期工资、生活护理费（如适用）等，这些费用根据员工的实际治疗情况和相关规定进行支付。
三、非工伤情形下的处理与赔偿
企业责任：
- 如果员工的疾病发作虽然与加班有关，但不满足工伤条件，企业可能不需要承担工伤赔偿责任。但是，如果加班与疾病发作存在因果关系，且企业存在过错（如明知员工身体状况不佳仍安排加班），企业可能需基于过错程度承担一定的民事赔偿责任。
- 此外，企业应给予员工适当的关怀和经济补助，具体数额和方式可以双方协商确定，体现企业的人文关怀。
赔偿考量因素：
- 医疗费用：企业可能需分担部分合理医疗费用，具体比例根据企业的过错程度、员工的实际损失以及地方规定等因素综合判定。
- 适当补偿：除了医疗费用外，法院还可能根据加班情况、企业过错、员工损失等因素，判决企业给予员工其他形式的适当补偿，如误工费、精神损害抚慰金等。
四、建议与注意事项
- 证据保留：员工应妥善保存加班记录、就医诊断、医疗费用发票等相关证据，以备在需要维权时提供有力支持。
- 协商解决：在赔偿事宜上，企业和员工应首先尝试通过友好协商解决分歧，达成双方都能接受的赔偿方案。
- 法律途径：如果协商无果，员工可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自身权益，确保自己的合法权益得到保障。
- 企业责任强化：企业应重视员工的健康与安全，合理安排工作，避免过度加班导致的健康问题。同时，企业应明确自身在员工加班及突发疾病方面的责任与义务，确保在类似事件发生时能够迅速、有效地应对。
综上所述，加班导致突发疾病的赔偿问题需要根据具体情况灵活处理。企业应依法履行责任，保障员工权益；员工也应了解自身权益，必要时采取合法手段维权。希望以上解答能够对您有所帮助。