结论：店长算账不对扣钱是否合理，需根据具体情况判断，若因店长计算错误导致员工工资被错误扣除，且该错误非员工原因造成，则不合理且可能违法；若员工存在过错或违反公司规定导致扣款，且扣款符合公司规章制度及法律规定，则可能合理。以下从不同角度详细分析：
一、店长算账错误导致员工工资被扣的情况
法律原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，员工有权获得与其劳动相应的报酬，且工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。
- 若店长因计算错误导致员工工资被错误扣除，且该错误非员工原因造成，那么这种扣款行为是不合理的，甚至可能构成违法。
员工权益：
- 员工有权要求店长或公司纠正错误，并补发被错误扣除的工资。
- 若公司拒绝纠正，员工可以向劳动监察部门投诉，或通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
公司责任：
- 公司应建立健全的工资计算和发放制度，确保员工工资的准确性和及时性。
- 若因公司管理不善或店长失误导致员工工资被错误扣除，公司应承担相应的责任，并尽快补发工资。
二、员工存在过错或违反公司规定导致扣款的情况
公司规章制度：
- 若公司规章制度中明确规定了员工在特定情况下（如迟到、早退、旷工、违反操作规程等）应承担的扣款责任，且该规章制度已经员工签字确认或经过民主程序制定并公示，那么这种扣款行为可能是合理的。
- 但扣款金额应合理，不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
法律规定：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
实际操作：
- 在实际操作中，公司应确保扣款行为有明确的依据和合理的计算方式，并保留相关证据以备查。
- 若员工对扣款行为有异议，公司应提供充分的解释和证据，以维护双方的合法权益。
三、建议与总结
对于员工：
- 若发现店长算账不对导致工资被扣，应首先与公司或店长沟通，要求纠正错误并补发工资。
- 若沟通无果，可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
对于公司：
- 应建立健全的工资计算和发放制度，确保员工工资的准确性和及时性。
- 在制定和执行扣款政策时，应确保符合法律法规和公司规章制度的要求，并充分尊重员工的合法权益。
总之，店长算账不对扣钱是否合理，需根据具体情况判断。若因店长计算错误导致员工工资被错误扣除，且该错误非员工原因造成，则不合理且可能违法；若员工存在过错或违反公司规定导致扣款，且扣款符合公司规章制度及法律规定，则可能合理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。