结论：在签订冷库项目合同并支付部分货款后，若因甲方原因导致三年后开工，乙方在一定条件下是有可能追诉保管费的，但具体能否追诉及追诉的金额，需根据合同条款、实际损失情况以及相关法律规定来综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、合同条款的约定
保管费条款：首先，需要查看合同中是否明确约定了因甲方原因导致开工延迟时，乙方有权收取保管费或类似费用的条款。如果合同中有明确约定，那么乙方在符合约定条件的情况下，有权依据合同条款向甲方追诉保管费。
违约责任条款：其次，合同中可能包含违约责任条款，规定了因一方违约给对方造成损失时，违约方应承担的赔偿责任。如果甲方因自身原因导致开工延迟，且该延迟给乙方造成了保管货物的额外费用等损失，乙方可以依据违约责任条款要求甲方赔偿。
二、实际损失情况
保管费用的实际发生：乙方需要证明因甲方原因导致开工延迟期间，确实发生了保管货物的额外费用，如仓储费、管理费等。这些费用应当是合理且必要的，且能够提供相应的证据予以支持。
损失与甲方行为的因果关系：乙方还需要证明这些保管费用的发生与甲方原因导致的开工延迟之间存在直接的因果关系。即，如果甲方按时开工，这些保管费用就不会发生。
三、相关法律规定
《民法典》合同编：根据《民法典》合同编的相关规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。如果甲方因自身原因导致开工延迟，且该延迟给乙方造成了损失，乙方有权要求甲方承担赔偿责任。
保管合同的相关规定：虽然本案例主要涉及的是货物买卖合同，但如果合同中包含了保管货物的条款，或者乙方因甲方原因需要额外保管货物，那么也可以参照保管合同的相关规定来处理。根据保管合同的规定，保管人因保管不善造成保管物毁损、灭失的，保管人应当承担赔偿责任。但在此案例中，更侧重于因甲方原因导致的保管费用增加问题，而非保管物本身的损失。
四、建议与操作
协商解决：首先，建议乙方与甲方进行协商，就保管费的支付问题达成一致意见。这可以节省时间和成本，并维护双方的良好合作关系。
法律途径：如果协商无果，乙方可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。这包括向法院提起诉讼或申请仲裁等。在提起诉讼或申请仲裁前，乙方需要准备好相关证据材料，如合同、付款凭证、保管费用发票等，以证明自己的主张。
注意诉讼时效：需要注意的是，根据法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。因此，乙方在追诉保管费时，需要确保自己的请求没有超过诉讼时效期间。
总结：乙方在因甲方原因导致开工延迟并产生保管费用的情况下，是有可能追诉保管费的。但具体能否追诉及追诉的金额，需根据合同条款、实际损失情况以及相关法律规定来综合判断。如果乙方遇到此类问题，建议直接向我咨询，以便更准确地评估自己的权益并采取相应的法律措施。