在基本农田上挖塘种藕属于违法行为，将面临责令改正、限期恢复原状以及罚款等处罚措施。具体分析如下：

1. 法律依据与违法性认定
   根据《中华人民共和国土地管理法》第三十七条及《基本农田保护条例》第十七条，基本农田是依法划定的不得擅自占用或改变用途的耕地，禁止任何单位和个人在基本农田内挖塘养鱼、种藕等非农种植行为。此类行为直接违反了法律对基本农田用途的强制性规定，构成违法占用耕地。

2. 处罚措施与程序

   • 责令改正与限期恢复：县级以上人民政府自然资源主管部门将首先责令违法行为人停止挖塘种藕行为，并限期（通常为15-30日）填平鱼塘、恢复原种植条件。
     
   • 罚款处罚：若逾期未改正，将面临耕地开垦费2倍以下的罚款。例如，若当地耕地开垦费标准为每亩2万元，则罚款上限可达4万元/亩。
     
   • 刑事责任风险：若违法占用基本农田面积达到5亩以上，或造成耕地大量毁坏（如土壤层严重破坏），可能触犯《刑法》第三百四十二条【非法占用农用地罪】，面临五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金的刑事处罚。

3. 特殊情形说明

   • 历史遗留问题：若挖塘行为发生于《基本农田保护条例》实施前（1999年1月1日前），且符合当时政策，可能不构成违法；但若后续未补办手续或继续扩大规模，仍需承担法律责任。
     
   • 地方政府违规审批：若行为人经地方政府违规批准占用基本农田，该批准文件无效，行为人仍需承担恢复原状及罚款责任，同时可向相关部门追责。

建议：若已实施挖塘种藕行为，应立即停止并主动联系当地自然资源主管部门，申请补办手续或协商恢复方案，以减轻处罚。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。