您好，关于基本农田种藕是否合法的问题，这主要取决于农田的类型以及种植行为是否符合相关规定。

首先，我们需要明确的是，永久基本农田一般主要用于种植粮食作物，这是由《土地管理法》及相关政策所明确规定的。永久基本农田的特殊保护制度要求我们保持其种植粮食作物的现状不变，严禁将其转为其他农用地或农业设施建设用地，更严禁发展林果业、挖塘养鱼等行为。

然而，对于您提到的“种藕”行为，我们需要具体分析：

1. 如果农田属于永久基本农田：

   • 在这种情况下，种藕通常是不被允许的，因为藕的种植往往与挖塘养鱼等行为相关联，这违反了永久基本农田的保护规定。
   • 永久基本农田严禁挖塘养鱼，也严禁种植苗木、草皮等用于绿化装饰及其他破坏耕作层的植物，藕的种植如果涉及到破坏耕作层，那么同样是不被允许的。

2. 如果农田属于一般耕地：

   • 一般耕地主要用于粮食和棉、油、糖、蔬菜等农产品及饲草饲料生产。
   • 在不破坏耕地耕作层且不造成耕地地类改变的前提下，一般耕地可以适度种植其他农作物，包括藕。
   • 但需要注意的是，即使是在一般耕地上种植藕，也需要确保不破坏耕地的耕作层，不改变耕地的地类，并且符合当地的土地利用规划和农业政策。

此外，我还想提醒您的是，无论农田类型如何，任何改变土地用途或破坏耕地的行为都可能面临法律责任。根据《土地管理法》及相关规定，非法占用永久基本农田发展林果业或者挖塘养鱼的，将由县级以上人民政府自然资源主管部门责令限期改正，并可能面临罚款等处罚。

因此，我建议您在种植藕之前，先确认您所使用的农田类型，并了解当地的相关政策和规定。如果农田属于永久基本农田，那么种藕行为很可能是不合法的；如果农田属于一般耕地，并且您能够确保不破坏耕地的耕作层和不改变耕地的地类，那么您可以考虑适度种植藕。但无论如何，都请务必遵守当地的法律法规和政策要求。