核心结论：原三股东可以合并起诉受让方违约，且在符合法定条件的情况下，可以指定一人代诉。以下为具体操作方式及要点分析：

1. 合并起诉的法律依据与操作

   • 法律依据：根据《民事诉讼法》第五十二条，当事人一方或者双方为二人以上，其诉讼标的是共同的，或者诉讼标的是同一种类、人民法院认为可以合并审理并经当事人同意的，为共同诉讼。在企业转让中，若原三股东对受让方的违约行为均享有请求权（如基于同一转让协议中的违约条款），且诉讼标的属于同一种类（如均要求受让方支付违约金或赔偿损失），则三股东可作为共同原告合并起诉。
   • 操作要点：
     • 共同签署起诉状：三股东需共同签署起诉状，明确诉讼请求（如要求受让方支付违约金、赔偿损失等）、事实与理由（如受让方未按约定支付转让款、未履行合同义务等），并附上相关证据（如转让协议、付款凭证、违约通知等）。
     • 提交法院审查：将起诉状及证据提交至有管辖权的法院（通常为合同履行地或被告住所地法院），由法院审查是否符合合并审理的条件。若法院认为符合条件且当事人同意，将合并审理；若不符合，可能要求分别起诉或调整诉讼请求。

2. 指定一人代诉的法律依据与操作

   • 法律依据：根据《民事诉讼法》第五十三条，当事人一方人数众多的共同诉讼，可以由当事人推选代表人进行诉讼。推选代表人需满足以下条件：（1）代表人须为本案当事人；（2）代表人的诉讼行为对其所代表的当事人发生效力；（3）代表人变更、放弃诉讼请求或者承认对方当事人的诉讼请求，进行和解，须经被代表的当事人同意。在企业转让中，若原三股东人数不多（如仅三人），虽不严格属于“人数众多”的共同诉讼，但若三股东均同意由一人代表诉讼，可视为对诉讼权利的处分，法院通常不会干预。
   • 操作要点：
     • 签署授权委托书：三股东需共同签署授权委托书，明确指定一人（如第一大股东或协商确定的人选）为诉讼代表人，并载明代表人的权限范围（如代为起诉、应诉、承认、放弃、变更诉讼请求、进行和解等）。
     • 提交法院备案：将授权委托书作为起诉状的附件提交至法院，由法院备案并确认代表人的诉讼地位。在诉讼过程中，代表人的行为视为三股东的共同行为，但涉及重大利益处分（如和解、撤诉）时，需经三股东共同同意。

3. 风险提示与建议

   • 合并起诉的风险：若三股东的诉讼请求存在差异（如一人主张违约金，另一人主张赔偿损失），或诉讼标的非同一种类，法院可能拒绝合并审理，导致诉讼效率降低。建议三股东在起诉前充分协商，统一诉讼请求及事实与理由。
   • 指定代诉的风险：若代表人滥用诉讼权利（如未经同意擅自和解），可能损害其他股东的利益。建议三股东在授权委托书中明确代表人的权限范围及违约责任，并在诉讼过程中保持沟通，及时监督代表人的行为。
   • 证据收集与保全：建议三股东在起诉前充分收集证据（如转让协议、付款凭证、违约通知、沟通记录等），并在必要时申请法院采取证据保全或财产保全措施，以确保诉讼胜诉后能够顺利执行。

总结：原三股东在企业转让中因受让方违约而合并起诉时，需满足诉讼标的同一种类或共同的条件，并共同签署起诉状提交法院审查；若需指定一人代诉，需签署授权委托书并明确代表人的权限范围。在操作过程中，建议三股东充分协商、统一立场，并注意证据收集与保全，以降低诉讼风险。如有进一步疑问或需具体操作指导，可直接向我咨询。