关于村两委干部在厂里交社保是否合法的问题，这需要从多个方面来详细阐述。

首先，我们要明确的是，村民委员会是村民自我管理、自我教育、自我服务的基层群众性自治组织，它并不属于《工伤保险条例》或其他相关劳动法律法规所规定的“用人单位”范畴。村两委干部通常是通过选举产生的，他们与村委会之间的关系，并非劳动、人事关系，也非雇佣关系。

接下来，我们针对社保缴纳的具体情况进行分析。社保缴纳通常要求存在劳动关系或雇佣关系，并且由用人单位按照相关法律法规的规定，为员工缴纳社会保险费用。然而，在村两委干部的情况下，由于他们与村委会之间不存在上述关系，因此，从严格意义上讲，村两委干部并不直接由村委会作为用人单位来缴纳社保。

不过，这里需要特别说明的是，如果村两委干部同时在某个企业或工厂兼职或工作，并且与该企业或工厂建立了劳动关系或雇佣关系，那么他们就有权要求该企业或工厂按照相关法律法规的规定，为他们缴纳社会保险费用。这种情况下，村两委干部在厂里交社保就是合法的。

另外，从政策层面来看，目前工伤保险已实现省级统筹，对工伤保险政策、基金收支管理等方面进行了统一。但省级层面尚无政策将村干部纳入工伤保险参保范围，市级层面也无制定出台相关政策的权限。不过，一些地方可能会为村干部提供养老保险缴费补贴、离职补助或购买人身意外伤害保险等福利措施，以保障他们的基本权益。

综上所述，村两委干部在厂里交社保是否合法，主要取决于他们与该企业或工厂之间是否存在劳动关系或雇佣关系。如果存在，则合法；如果不存在，而仅由村委会作为自治组织来缴纳，则缺乏法律法规和政策依据。因此，在具体情况下，需要结合实际情况和相关法律法规进行判断。