针对您提出的“未按规定备案运输动物怎么处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、法律依据与备案要求
根据《中华人民共和国动物防疫法》的相关规定，从事动物运输的单位、个人及车辆，必须向所在地县级人民政府农业农村主管部门进行备案，并妥善保存运输过程中的相关信息。这是确保动物运输合规、防止疫病传播的重要措施。
二、未备案运输动物的处罚规定
若未按照上述规定进行备案而从事动物运输，将面临以下行政处罚：
责令改正：主管部门在发现未备案车辆后，会首先责令当事人立即改正违法行为，即尽快完成备案手续。
罚款：根据《中华人民共和国动物防疫法》第九十八条第三项的规定，未经备案从事动物运输的，由县级以上地方人民政府农业农村主管部门处以三千元以上三万元以下的罚款。若情节严重，如造成动物疫病传播风险或多次违规等，罚款额度可能提升至三万元以上十万元以下。
三、地方规定与处罚差异
值得注意的是，各地为了加强动物运输管理，可能会出台更为具体的地方性法规或规章。这些规定可能对未备案车辆的处罚措施和额度有所细化或调整。例如，某些地方可能规定对未备案车辆责令限期改正，逾期未改则处以固定额度的罚款（如五千元）。因此，在实际操作中，还需结合当地的具体规定来确定处罚措施。
四、处罚流程与影响因素
发现与责令改正：主管部门在巡查、检查或接到举报等方式发现未备案车辆后，会立即责令当事人改正违法行为。
罚款与严重情节处理：若当事人未及时改正或情节严重，主管部门将依法处以罚款。在决定罚款额度时，会考虑多种因素，如车辆是否造成动物疫病传播风险、是否积极配合整改等。
停业整顿：对于情节特别严重的违规行为，主管部门还可能责令当事人停业整顿，以进一步惩戒和纠正违法行为。
五、建议与指导
为了避免因未按规定备案而面临行政处罚，我建议您：
严格遵守法律：确保从事动物运输的车辆已按照规定进行备案，并妥善保存运输过程中的相关信息。
加强学习：提高对动物防疫法律法规的认识，增强法律意识和防疫责任，确保运输过程合规、安全。
积极整改：一旦被发现未备案或存在其他违规行为，应立即配合主管部门进行整改，以减轻可能的处罚。
综上所述，未按规定备案运输动物将面临责令改正、罚款甚至停业整顿等行政处罚。为了确保合规运输、保障动物健康，请务必严格遵守相关法律法规和规定。