结论前置：您因建房动了对方房子但持有审批手续的情况下，对方要求返还房屋是否有诉讼时效，这取决于对方主张权利的具体法律关系及您的行为性质，不同情形下诉讼时效的适用和结果会有所不同。以下从几个可能的角度进行分析：
若对方主张的是物权保护（如相邻权侵害）：
- 法律背景：根据《民法典》中关于物权保护的规定，物权请求权一般不受诉讼时效的限制，特别是当涉及到对物权的侵害持续存在时。若您的建房行为持续影响了对方的房屋结构安全、采光、通风等相邻权益，对方有权要求您停止侵害、排除妨碍或恢复原状，且这些请求权通常不适用诉讼时效的规定。
- 法律建议：在此情况下，对方提起诉讼可能不受诉讼时效的限制，您应重点审查自己的审批手续是否合法合规，以及建房行为是否确实侵犯了对方的相邻权。若存在侵权，应积极与对方协商解决，或准备应对可能的法律诉讼。
若对方主张的是侵权责任（如因建房导致房屋损坏）：
- 法律背景：根据《民法典》中关于侵权责任的规定，因侵权行为产生的损害赔偿请求权，一般适用诉讼时效的规定。诉讼时效期间通常为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
- 法律建议：在此情况下，若对方在知道或应当知道房屋受损之日起三年内未提起诉讼，则可能因超过诉讼时效而丧失胜诉权。但需注意，若存在诉讼时效中断、中止等情形，诉讼时效期间可能重新计算或延长。您应审查对方提起诉讼的时间是否在诉讼时效期间内，并准备相应的抗辩理由。
若对方主张的是合同违约责任（如双方存在建房相关合同）：
- 法律背景：若您与对方之间存在关于建房的合同关系，且您的行为违反了合同约定，对方有权依据合同约定要求您承担违约责任。合同违约责任的诉讼时效同样适用《民法典》中关于诉讼时效的规定。
- 法律建议：在此情况下，您应审查合同内容、违约事实及对方提起诉讼的时间是否在诉讼时效期间内。若合同中有关于诉讼时效的特别约定，应优先适用合同约定。同时，您应评估自己的违约责任范围及可能的赔偿金额，准备应对诉讼或协商解决。
进一步思考：无论对方主张的是哪种法律关系，您都应重视自己的审批手续是否合法合规。若审批手续存在问题，即使对方提起诉讼时超过了诉讼时效，您也可能因行政违法而面临其他法律责任。因此，建议您在处理此类纠纷时，不仅关注诉讼时效问题，还应全面审查自己的行为合法性，并积极与对方协商解决纠纷。
最后，若您在此类纠纷中遇到复杂情况或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。