政府修路借用水田是否合法，主要取决于其是否遵循了法定程序以及是否给予了合理补偿。以下从合法与不合法两种情形进行详细分析：
合法情形
履行法定程序：
- 政府修路占用土地，包括借用水田，必须基于公共利益的需要，并严格按照《中华人民共和国土地管理法》等法律法规规定的程序进行。这包括获得相关部门的审批，如土地管理部门的批准，确保用地手续的合法性。
- 具体来说，政府应开展拟征收土地现状调查和社会稳定风险评估，并在拟征收土地所在的乡（镇）和村、村民小组范围内进行公告，听取相关利害关系人的意见。若多数被征地的农村集体经济组织成员认为征地补偿安置方案不符合法律法规，政府还应组织召开听证会，并根据情况修改方案。
给予合理补偿：
- 政府在借用水田修路时，应按照规定给予农民合理的经济补偿。补偿内容应包括土地补偿费、安置补助费以及农村村民住宅、其他地上附着物和青苗等的补偿费用，确保农民的合法权益得到保障。
- 补偿标准应由省、自治区、直辖市制定，综合考虑土地原用途、土地资源条件、土地产值、土地区位、土地供求关系、人口以及经济社会发展水平等因素，并至少每三年调整或者重新公布一次。
与农民协商一致：
- 政府应与农民就土地借用事宜进行充分的沟通和协商，尊重农民的意愿。在平等、自愿的基础上签订土地借用协议，明确双方的权利和义务，包括借用期限、借用费用支付方式、土地使用要求等内容。
不合法情形
未经合法审批：
- 若政府未按照法定程序获得土地管理部门等相关部门的批准，擅自借用水田用于修路，则此行为违法。缺乏合法的审批手续将违反土地管理的相关规定。
补偿不合理或不支付补偿：
- 政府在借用水田过程中，若未给予农民合理的补偿，或拖延、拒绝支付补偿费用，将严重损害农民的合法权益，违反公平、合理补偿的原则，构成违法行为。
强迫农民借用土地：
- 政府不得采取威胁、恐吓等手段强迫农民将水田借给政府用于修路。农民的土地权益受法律保护，任何单位和个人都不得侵犯。
特殊情况说明与救济措施
- 临时施工占用：若只是临时施工占用水田，政府可以适当支付占借费，但应确保不影响农民的正常生产生活，并在施工结束后及时恢复土地原状。
- 救济措施：若政府修路借用水田的行为不合法，农民有权向法院起诉，要求政府承担相应的法律责任。同时，农民还可以向上级部门反映强行征地行为，或提起行政复议和行政诉讼。对征地存有异议的，还可向有关部门申请听证。
总结来说，政府修路借用水田的合法性取决于其是否严格遵循了法定程序和给予了合理补偿。对于任何违反规定的行为，农民均有权采取相应救济措施来维护自己的合法权益。若您遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。