迟到一小时扣全天工资，在大多数情况下是不合理且可能违法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与解读
《中华人民共和国劳动法》第五十条：
- 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。迟到一小时扣全天工资，明显属于无故过度扣减工资的情况，违反了该条款的规定。
《工资支付暂行规定（1994年版）》第十五条：
- 用人单位不得克扣劳动者工资，仅在特定情况下（如代扣代缴个人所得税、社会保险费用等）可以代扣。迟到一小时并不属于这些可代扣工资的情形，因此，迟到一小时扣全天工资不符合该规定。
《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定：
- 用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。迟到这种短暂出勤缺失，扣一天工资显然超出了合理惩处范围，构成对劳动者工资的克扣。
二、合理性分析
劳动合同约定：
- 若劳动合同中明确约定了迟到一小时扣一天工资的条款，且该条款是双方自愿协商达成的，虽具有一定合法性，但必须不违反法律法规的强制性规定，如最低工资标准等。然而，这种极端扣罚很难被视为合理，且在实际操作中可能因违反公平公正原则而被认定为无效。
规章制度规定：
- 若劳动合同未作此约定，用人单位单方面规定迟到一小时扣一天工资，则属于擅自变更劳动合同内容，是不合法的行为。劳动者有权拒绝该规定，并要求按照正常工资计算方式支付。
扣罚金额合理性：
- 即便有劳动合同或规章制度约定，扣罚工资的数额也应合理。迟到一小时扣一天工资的规定明显不合理，给劳动者造成较大经济损失。劳动者有权向劳动监察部门投诉，要求纠正或给予合理补偿。
公平公正原则：
- 劳动者付出了大部分的劳动时间，仅因一小时迟到就被扣除一整天的劳动所得，严重损害了劳动者获取劳动报酬的合法权益，违背了公平公正原则。
三、实际建议与操作指南
对于用人单位：
- 应依法建立和完善规章制度，确保内容合法、合理且经过民主程序制定。
- 在处理员工迟到等问题时，应遵循合法、合理、公平的原则，避免过度处罚。
- 建议设定合理的迟到扣罚措施，如迟到一次扣除一定金额，并确保该金额与迟到造成的影响相对合理匹配。
对于劳动者：
- 应了解自己的权益和义务，对用人单位的不合理规定有权提出异议并要求纠正。
- 如遇到权益受损的情况，应先与用人单位沟通协商；协商不成时，可向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁乃至提起诉讼来维护自己的合法权益。
综上所述，迟到一小时扣全天工资的做法不仅不合理，而且在多数情况下可能违法。用人单位和劳动者都应充分了解相关法律法规，确保在处理此类问题时能够依法行事，保护双方的合法权益。如果您有进一步的法律问题或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。