合同约定要签字但是只盖了合同章，合同在一般情况下仍然可能是有效的，但具体效力需根据法律规定、合同的具体约定以及实际履行情况来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、法律基础与基本原则
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这表明，签字、盖章、按指印在合同成立上具有同等法律效力。因此，在合同中仅约定需要签字，但实际只盖了合同章的情况下，合同并不必然无效。
二、合同效力的具体分析
合同约定的影响：
- 如果合同中仅提及“签字生效”，但未明确排除盖章的效力，那么盖章可以视为合同成立并生效的有效方式。此时，即便没有签字，合同仍然可能具有法律效力。
- 如果合同中明确约定“合同自双方签字且盖章之日起生效”，则只盖章未签字的合同可能不符合双方约定的生效条件，其效力将存疑。但即便如此，如果一方已经履行了合同的主要义务，且对方接受，该合同仍可能被视为成立并生效。
实际履行情况的重要性：
- 即使合同未同时满足签字和盖章条件，但如果一方已经履行了合同的主要义务，且对方已接受，根据《民法典》的规定，该合同仍被视为成立并生效。这体现了法律对实际履行行为的认可和保护。
盖章主体与印章真伪：
- 盖章主体的权限以及印章的真伪也是影响合同效力的关键因素。若盖章并非合同约定主体所盖，或印章存在伪造等情形，合同的效力将受到严重影响。
三、特殊情况与建议
特殊行业或领域的合同：
- 在某些特殊行业或领域，如金融、房地产等，可能存在特定的规定或惯例要求合同必须同时签字和盖章才生效。在这种情况下，如果合同仅盖章而未签字，可能不符合这些特定规定或惯例的要求，从而影响合同的效力。但即便如此，也需要结合具体情况来判断合同是否真正无效。
建议与实践：
- 为避免后续纠纷的发生，建议在签订合同时，双方应明确约定生效条件及签字盖章事宜。这包括但不限于明确是“签字或盖章”还是“签字并盖章”生效，以及盖章的具体要求（如盖章主体、印章类型等）。
- 如果在实际操作中遇到只盖章未签字的情况，应及时与对方沟通确认合同的效力，并考虑是否需要补充签字或采取其他补救措施。
总结来说，合同约定要签字但是只盖了合同章，合同的效力并非绝对无效，而是需根据具体情况进行综合判断。如果你在实际操作中遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。