针对您提出的“合同约定了需要签字盖章生效，只盖章是否有效”的问题，这确实是一个涉及合同法和实际交易习惯的重要问题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这里的“签名、盖章或者按指印”是并列关系，意味着只要满足其中之一，合同在法律上就可以视为成立。但具体到您的情境，合同中明确约定了“需要签字盖章生效”，这实际上是对合同生效条件的一个特定约定。
一、合同约定的具体分析
一般原则：如果合同中仅提及“盖章签字生效”，但并未明确说明必须同时具备两者，那么从法律的角度来看，盖章或签字中的任何一项完成，都足以使合同成立并产生法律效力。因此，在这种情况下，只盖章而未签字的合同，仍然可能是有效的。
特定约定：然而，如果合同中明确约定了“必须同时盖章和签字合同才生效”，那么这就构成了一个特定的生效条件。在这种情况下，如果只有盖章而没有签字，合同的效力就会受到质疑。此时，我们需要结合具体的证据和事实，如双方的实际交易习惯、合同履行情况等，来综合判断合同的效力。
二、实际履行情况的影响
即使合同未同时满足盖章和签字的条件，但如果一方已经履行了合同的主要义务，并且对方已经接受，那么根据《民法典》的规定，该合同仍然被视为成立并生效。这是因为，合同的本质在于双方当事人的真实意思表示和实际履行情况，而不仅仅是形式上的签字和盖章。
三、其他关键因素
真实意思表示：合同的内容必须不违反法律法规的强制性规定，并且是双方真实意思的表示。这是合同有效性的基本要求。如果盖章并非出于双方的真实意思表示，或者存在欺诈、胁迫等情形，那么合同的效力将受到严重影响。
盖章主体与印章真伪：盖章主体的权限以及印章的真伪也是影响合同效力的关键因素。如果盖章并非合同约定主体所盖，或者印章存在伪造等情形，那么合同的效力将受到质疑。
四、建议与实践
为了避免后续纠纷的发生，我建议您在签订合同时，双方应明确约定生效条件及签字盖章事宜。这包括但不限于明确是“签字或盖章”还是“签字并盖章”生效，以及盖章的具体要求（如盖章主体、印章类型等）。同时，在合同履行过程中，双方应保留好相关证据，如邮件、短信、录音等，以证明双方的真实意思表示和合同履行情况。
综上所述，合同约定盖章签字生效但只有盖章的情况下，合同是否有效需结合具体的合同约定、相关法律法规的规定以及实际情况进行综合判断。在实践中，应充分考虑各种因素，以确保合同的合法性和有效性。