针对您提出的“合同约定双方签字盖章，但只盖章了是否有效”的问题，我的结论是：合同在仅有盖章而无签字的情况下，其效力并非绝对无效，而是需根据具体情况进行综合判断。以下是我从不同角度为您详细分析的情况：
一、法律基础与一般原则
根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这表明，“签字、盖章”在法律上是选择关系，任何一项的完成都足以使合同成立。依法成立的合同，自成立时即产生法律效力，除非存在特别约定或法律法规另有规定。因此，在一般情况下，如果合同中没有特别约定必须同时签字和盖章，那么仅盖章也是有效的。
二、合同约定与生效条件
一般约定：
- 若合同中仅提及“盖章签字生效”，但未明确必须同时具备两者，则盖章即可视为合同成立并生效的有效方式。此时，即便没有签字，合同仍然可能具有法律效力。
特定约定：
- 如果双方在实际交易习惯中有明确约定，或对“盖章签字生效”有特定的理解，即认为必须同时满足盖章和签字条件合同才生效，那么仅有盖章时合同效力将存疑。此时，需要结合具体证据和事实来认定合同的效力，比如双方之前的交易记录、沟通记录等。
实际履行情况：
- 即使合同未同时满足盖章和签字条件，但如果一方已经履行了合同的主要义务，且对方已接受，根据《民法典》的规定，该合同仍被视为成立并生效。这是法律对实际履行行为的认可和保护。
三、特殊情况考虑
盖章主体与印章真伪：
- 盖章主体的权限以及印章的真伪也是影响合同效力的关键因素。若盖章并非合同约定主体所盖，或印章存在伪造等情形，合同的效力将受到严重影响。在这种情况下，即使合同上有盖章，也可能因为盖章主体或印章的问题而导致合同无效。
合同内容合法性：
- 合同必须是当事人之间自愿签订的，且内容合法，不违背公序良俗。这是合同有效性的基础。如果合同内容存在违法或违背公序良俗的情况，那么即使合同上有盖章，也可能导致合同无效。
四、建议与实践
明确约定生效条件：
- 为避免后续纠纷的发生，建议在签订合同时，双方应明确约定生效条件及签字盖章事宜。这包括但不限于明确是“签字或盖章”还是“签字并盖章”生效，以及盖章的具体要求（如盖章主体、印章类型等）。
保留相关证据：
- 在签订和履行合同过程中，建议双方保留好相关证据，如沟通记录、交易记录、履行凭证等。这些证据在后续可能发生的纠纷中，将起到至关重要的作用。
及时咨询与处理：
- 如果在合同签订或履行过程中遇到任何问题或疑虑，建议及时咨询专业律师（即我本人）进行处理。我将根据您的具体情况和需求，为您提供专业、全面的法律服务。
综上所述，合同约定盖章签字生效但只有盖章的情况下，合同是否有效需结合具体的合同约定、相关法律法规的规定以及实际情况进行综合判断。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。