商铺合同到期后的占用费计算是一个涉及多个因素的综合考量过程。以下是对此问题的详细解答：

一、依据合同约定

首先，如果商铺租赁合同中明确约定了合同到期后占用费的计算方式，那么应当按照合同约定来执行。这通常是最直接且最具法律效力的计算依据。合同中可能规定了按日、按月或按面积计算的固定费用，或者基于原租金的一定比例来计算占用费。同时，还需要考虑合同中的其他相关条款，比如租金递增条款、逾期支付违约金等，这些都可能影响最终的费用计算。

二、无合同约定或约定不明的情况

如果合同中未约定占用费或者约定不明确，那么可以参考以下方式来确定占用费：

1. 市场租金水平：可以参照同地段、同类型商铺的市场租金水平来确定占用费。这通常需要通过调查周边类似商铺的租金来实现，以确保占用费的合理性。

2. 实际使用情况：

   • 使用时间：需要精确确定占用的起始和结束时间，按实际天数或月数来计算。
   • 使用用途：根据商铺的具体用途（如零售、仓储等）来调整占用费。一般来说，高利润行业的占用费可能会更高。
   • 商铺面积：按照每平方米的单价乘以实际占用的面积来计算。

3. 收益损失考虑：如果由于占用导致商铺无法经营，那么还需要考虑商铺在正常经营下的收益损失，并适当提高占用费以补偿这部分损失。

三、其他考量因素

1. 区域与性质：

   • 不同区域可能有不同的占用费标准，如城市中心区域和郊区可能会有显著差异。
   • 土地的性质（如商业用地、工业用地等）也会影响占用费的计算。一般来说，商业用地的占用费会高于工业用地。

2. 法律规定与司法实践：

   • 在计算占用费时，必须遵守当地关于商铺租金或占用费的相关法律法规，包括可能的费用上限和指导意见。
   • 通过查阅类似案件的判决结果，可以了解法院在确定占用费时考虑的因素和计算方法，以确保计算的合理性。

四、特殊情况与处理建议

1. 非法占用：如果占用行为是非法的，那么除支付占用费外，还可能面临罚款等行政处罚。罚款金额通常根据情节严重程度来确定。

2. 咨询与建议：由于占用费计算涉及多个复杂因素，建议在实际操作中咨询当地相关部门或专业律师。他们可以提供专业的法律意见和计算建议，以确保计算的准确性和合法性。

综上所述，商铺合同到期后的占用费计算是一个综合考量的过程。在计算时，既需要依据合同约定和市场情况，也需要遵循法律法规和司法实践。通过全面、准确地考虑各种因素，可以确保占用费的计算既合理又合法。