结论前置：商铺到期未续签合同，三个月后搬离物品的费用计算需结合租赁合同约定、实际损失情况及双方协商结果综合判定，具体分以下情况说明：

1. 合同有明确约定时，按约定执行

若原租赁合同中已明确“合同到期未续签，承租人逾期搬离的，每日按租金XX%支付占用费”或“搬离费用（如仓储费、保管费）由承租人承担”，则搬离物品的费用应按合同条款计算。
法律依据：根据《民法典》第510条，合同生效后，当事人就质量、价款等未约定或约定不明的，可协议补充；无法补充的，按合同相关条款或交易习惯确定。
操作建议：先核查合同文本，若存在此类条款，出租方有权要求承租方按约定支付费用；承租方若认为费用过高，可主张条款显失公平（如占用费远超市场租金），但需举证证明。

2. 合同无约定时，按实际损失或合理费用计算

若合同未约定搬离费用，则需根据实际损失或合理支出主张费用，常见包括：

• 仓储费/保管费：若出租方因承租方未及时搬离，需额外租赁仓库保管物品，可主张实际支付的仓储费用（需提供合同、发票等证据）；
  
• 场地占用费：若承租方继续占用商铺导致出租方无法出租，可主张按原租金标准或市场租金计算的占用损失（需证明出租方因占用遭受的实际损失）；
  
• 搬运费：若出租方代为搬运物品，可主张实际支付的搬运费用（需提供搬运合同、付款凭证等）。
  法律依据：根据《民法典》第577条，当事人一方不履行合同义务，应承担继续履行、采取补救措施或赔偿损失等违约责任。
  操作建议：出租方需保留费用支出的证据（如合同、发票、转账记录），承租方若认为费用不合理，可要求出租方提供费用明细并协商核减。

3. 双方协商优先，协商不成可诉讼解决

若对费用计算存在争议，建议双方先协商确定合理金额（如按实际占用天数折算租金、分摊仓储费等）；协商不成的，出租方可向法院起诉，要求承租方支付费用，同时需承担举证责任（证明费用实际发生且合理）。
风险提示：若出租方未及时主张权利（如超过3年诉讼时效），可能丧失胜诉权；承租方若认为费用过高，可反诉要求调整（如主张占用费过高部分无效）。

总结：搬离费用的计算需以合同约定为优先，无约定时按实际损失或合理费用主张，关键在于证据保留（合同、发票、沟通记录等）。若仍有疑问，可直接向我咨询具体案件细节，我会进一步分析。