“两班倒超过12小时”是否违法，需根据具体工时制度、工作安排及是否依法支付加班费等因素综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、标准工时制度下的判断
法定工时标准：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这是保障劳动者休息权益的基本规定。
超出法定工时的违法性：
- 若用人单位未经批准实行“两班倒超过12小时”的工作制度，且导致劳动者工作时间明显超出每日八小时、每周四十四小时的标准，则构成违法。
休息休假权利：
- 用人单位应保证劳动者每周至少休息一日。若“两班倒超过12小时”的工作制度导致劳动者无法享受这一基本权利，同样构成违法。
二、特殊工时制度下的判断
综合计算工时工作制：
- 经劳动行政部门批准实行综合计算工时工作制的用人单位，其综合计算工作时间周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间（如以月为周期，约为176小时）。
- 若“两班倒超过12小时”导致周期内工作时间总和超标，超出部分应视为延长工作时间，用人单位需依法支付加班费；未超标则不违法。
不定时工作制：
- 在不定时工作制下，无固定上下班时间限制。因此，单纯的“两班倒超过12小时”不能直接认定违法。
- 但用人单位仍需确保职工的休息休假权利得到保障，避免过度延长工作时间对劳动者身心健康造成损害。
三、加班费支付规定
- 无论何种工时制度，若用人单位安排劳动者延长工作时间，均需依法支付加班费：
- 安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
- 休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
- 法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
四、特殊情况下的延长工作时间
- 在特定情况下，如因生产经营需要并经过工会和劳动者同意，企业可以延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；
- 若有特殊原因需延长工作时间，在保障劳动者身体健康的条件下，每日不得超过三小时，每月不得超过三十六小时。
五、法律后果与应对措施
- 行政处罚：若用人单位违反劳动法规定，实行“两班倒超过12小时”的工作制度，可能面临劳动行政部门的警告、责令改正及罚款等行政处罚。
- 民事赔偿：劳动者有权要求用人单位支付加班费、经济补偿金等民事赔偿。
- 劳动者应对措施：若劳动者认为用人单位的工作制度违法，可向劳动行政部门投诉或寻求法律援助，维护自己的合法权益。
总结与建议：
“两班倒超过12小时”的工作制度是否违法，需结合具体的工时制度、工作安排以及是否依法支付加班费等因素综合判断。用人单位应严格遵守劳动法的规定，合理安排劳动者的工作时间和休息休假，确保劳动者的身心健康和合法权益得到充分保障。若您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。