结论：针对您提出的“门店出租五年合同开了二年乙方违约合同约定违约金赔1年租金不想掏，您是否应该收取”的问题，这主要取决于合同的具体条款、乙方的违约情况以及您的实际损失，但从合同约定和法律原则出发，您有权要求乙方按照合同约定支付一年的租金作为违约金。以下是对此问题的详细分析：

一、合同约定的效力

1. 合同自由原则：在合同法中，合同自由原则是一项基本原则，即当事人有权自由约定合同的内容，包括违约责任。因此，如果合同中明确约定了乙方违约时需支付一年租金作为违约金，那么这一条款在合同有效期内对双方均具有约束力。
2. 违约金的性质：违约金是合同当事人在合同中约定的，一方违约时应当向对方支付的一定数额的金钱。它具有补偿性和惩罚性双重性质，旨在弥补守约方因违约行为所遭受的损失，并惩罚违约方的不诚信行为。

二、乙方的违约情况

1. 违约事实：乙方在合同履行过程中，未经您同意擅自提前解约，这构成了违约行为。根据合同法的规定，乙方应当承担违约责任。
2. 违约责任的承担：既然合同中已经明确约定了违约责任（即支付一年租金作为违约金），那么乙方就应当按照这一约定来承担责任。除非乙方能够证明这一约定显失公平或者存在其他法定免责事由，否则乙方无权拒绝支付。

三、您的实际损失与违约金的关系

1. 实际损失：虽然合同中约定了违约金，但您在实际操作中还需要考虑自己的实际损失情况。如果乙方的违约行为给您造成的损失超过了合同约定的违约金数额，那么您有权要求乙方赔偿超过部分的损失。然而，在本案例中，您并未提及实际损失超过违约金的情况，因此我们主要关注合同约定的违约金。
2. 违约金的调整：在极少数情况下，如果合同约定的违约金过高或者过低，法院或者仲裁机构可能会根据当事人的请求对违约金数额进行调整。但这一调整通常需要以实际损失为基础，并考虑合同的履行情况、当事人的过错程度等因素。在本案例中，除非乙方能够证明合同约定的违约金过高且给您造成的损失远低于这一数额，否则法院或者仲裁机构不太可能对违约金进行调整。

四、建议与行动

1. 与乙方协商：在采取法律行动之前，您可以先尝试与乙方进行协商，看是否能够达成和解协议。这有助于节省时间和成本，并维护双方的关系。
2. 发送律师函：如果协商无果，您可以考虑委托律师向乙方发送律师函，正式要求乙方按照合同约定支付违约金。律师函通常具有一定的威慑力，能够促使乙方认真对待此事。
3. 提起诉讼：如果乙方仍然拒绝支付违约金，那么您有权向法院提起诉讼，要求法院判决乙方支付违约金及可能产生的其他费用（如诉讼费、律师费等）。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明乙方的违约行为以及合同约定的违约金数额。

最后，针对您的情况，我建议您先仔细审查合同条款，确认违约金的约定是否明确且合法有效。然后，您可以尝试与乙方进行协商，看是否能够达成和解。如果协商无果，您可以考虑采取法律行动来维护自己的合法权益。如果您在此过程中有任何疑问或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。