结论前置：在合同中明确约定了有效的仲裁条款时，当事人通常应先申请仲裁解决争议，而不能直接向法院起诉。不过，也存在特定情况下当事人可直接向法院起诉的例外。以下是对这一问题的详细分析：
一、仲裁条款的法律效力与优先性
法律效力：
- 根据《中华人民共和国仲裁法》第五条，当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。这意味着，一旦合同中明确约定了仲裁条款，该条款对双方当事人具有法律约束力，排除了法院对约定范围内争议的司法管辖权。
优先性原则：
- 仲裁是双方自愿选择的争议解决方式，体现了意思自治原则。在有仲裁约定的情况下，应优先按照仲裁协议进行争议解决，而非直接诉诸法院。这是基于“或裁或审”及“一裁终局”的制度设计，旨在提高争议解决效率，降低当事人的时间和金钱成本。
二、特殊情况下的例外
尽管仲裁条款具有优先性，但也存在特定情况下当事人可直接向法院起诉的例外：
仲裁协议无效：
- 若仲裁协议本身存在无效情形，如约定的仲裁机构不存在、仲裁事项超出法律规定的仲裁范围、签订人不具备相应民事行为能力等，则当事人可以向法院起诉。此时，仲裁条款不具有法律效力，无法排除法院的司法管辖权。
放弃仲裁协议：
- 如果双方当事人通过明确行为或书面协议放弃了原有的仲裁协议，例如纠纷发生后一致同意通过诉讼解决并签订相关协议，或直接向法院起诉且对方未在规定时间内提出异议（根据《中华人民共和国仲裁法》第二十六条，视为放弃仲裁协议），则法院有权受理案件。
三、实际操作建议
仔细审查仲裁条款：
- 在签订合同时，当事人应仔细审查仲裁条款的约定，确保其符合法律法规的要求。仲裁条款应明确表达申请仲裁的意思，仲裁事项必须与当事人有特定的法律关系，且限于合同纠纷或其他财产权益纠纷，同时必须写明具体的仲裁委员会名称。
遵循争议解决方式：
- 在发生争议时，当事人应严格按照合同约定和法律规定的方式解决纠纷。如果合同中约定了有效的仲裁条款，则应优先申请仲裁解决争议。如果存在仲裁协议无效或放弃仲裁协议等例外情况，则可以选择向法院起诉。
寻求专业法律帮助：
- 在处理合同纠纷时，当事人可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保障。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。
举例说明：假设甲乙双方签订了一份买卖合同，并在合同中明确约定了仲裁条款，约定因合同产生的争议应提交至某仲裁委员会进行仲裁。后来，双方因合同履行问题产生争议。在此情况下，甲或乙应首先按照仲裁条款的约定，向约定的仲裁委员会申请仲裁解决争议。如果仲裁条款无效或双方一致同意放弃仲裁协议并签订了相关协议，则可以选择向法院起诉解决纠纷。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。