当公司因撤销部门或店铺撤店而需要与员工解除劳动合同时，赔偿标准主要依据《劳动合同法》及相关法律法规，并结合具体情况进行细致分析。以下是对不同情境下赔偿标准的详细阐述：

一、公司撤销部门导致劳动合同解除的赔偿标准

1. 合法解除且需支付经济补偿的情形：

   • 条件：若公司撤销部门属于客观情况发生重大变化，如业务调整、市场变化等，致使原劳动合同无法继续履行，并且用人单位与劳动者经协商未能就变更劳动合同内容达成一致意见，公司可以依法解除劳动合同，但需承担经济补偿责任。
   • 经济补偿计算标准：
     • 根据劳动者在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资作为经济补偿。
     • 工作满六个月但不满一年的，按一年计算；不满六个月的，则支付半个月工资的经济补偿。
     • 若劳动者月工资高于所在直辖市或设区的市级人民政府公布的上年度职工月平均工资三倍，经济补偿金将按此三倍数额支付，且最高支付年限不超过十二年。月工资指的是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
   • 实例：假设员工甲在公司工作3年7个月，其解除合同前12个月的平均工资为8000元。由于工作年限按4年计算，因此公司应支付甲32000元（4×8000）作为经济补偿。

2. 违法解除需支付赔偿金的情形：

   • 条件：如果公司撤销部门并非基于客观情况发生重大变化，或者未与员工协商即直接解除劳动合同，此类行为构成违法解除。
   • 赔偿金计算标准：赔偿金为经济补偿标准的两倍。即按照上述经济补偿的计算方法得出的金额再乘以2。
   • 实例：假设员工乙在公司工作2年2个月，其解除合同前12个月的平均工资为6000元。在违法解除的情况下，乙应获得的经济补偿为15000元（2.5×6000），因此赔偿金为30000元（15000×2）。

3. 无需支付补偿或赔偿的情形：

   • 如果员工存在《劳动合同法》第三十九条所规定的严重违反用人单位规章制度、严重失职等行为，即使因公司撤销部门而解除劳动合同，公司也无需支付经济补偿或赔偿金。

二、店铺撤店时的赔偿标准

店铺撤店时的赔偿标准与公司撤销部门类似，但还需考虑与房东、合作伙伴等之间的合同关系。

1. 针对员工的赔偿：

   • 与公司撤销部门时的赔偿标准相同，即根据合法解除或违法解除的不同情况，支付经济补偿或赔偿金。

2. 针对房东的赔偿：

   • 协商解除租赁合同：如公司与房东协商一致提前解除合同，赔偿事宜应根据租赁合同中约定的违约金或计算方式确定。
   • 单方违约解除租赁合同：若公司未经房东同意擅自撤店，构成单方违约，需承担违约责任。赔偿标准通常为损失赔偿额应相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可获得的利益，但不得超过违约一方订立合同时预见到的可能损失。

3. 针对合作伙伴的赔偿：

   • 有协议约定的情况：如公司与合作伙伴之间有合作经营协议，且协议中对撤店等情况有明确约定，应按协议进行赔偿。赔偿标准包括约定的违约金及对方因撤店而遭受的直接经济损失。
   • 无协议约定的情况：若无书面协议或协议中无撤店赔偿约定，双方应协商补充约定。协商不成时，按照合同相关条款或交易习惯确定赔偿标准。仍需赔偿对方因撤店所遭受的实际损失，包括可得利益的损失。

三、实际操作建议

1. 保持沟通：在处理撤店或撤销部门赔偿问题时，双方应保持有效沟通，尽量通过协商达成一致意见。
2. 寻求专业帮助：如有必要，可寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益并确保赔偿标准的合理性与合法性。

综上所述，公司在撤销部门或店铺撤店并解除员工劳动合同时，必须严格遵守相关法律法规，确保员工的合法权益得到充分保障。同时，员工也应了解自身权利，积极寻求法律途径解决争议。