针对您提出的“公司付了材料款对方不开发票违法吗”这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
首先，我们要明确的是，当公司支付材料款时，这笔款项对应的业务性质通常是销售货物或提供应税服务，这属于应税行为的范畴。根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，对于依法需要办理税务登记的经营主体（如企业、个体工商户等），在对外发生经营业务收取款项时，必须向付款方开具发票。
针对您的情况分析：
如果对方是依法办理了税务登记的经营主体：
- 那么他们在收到您的材料款后，有义务向您开具发票。如果他们未开具发票，就违反了发票管理的相关规定，可能面临税务机关的责令改正、罚款及违法所得没收等处罚。
如果对方是依法不需要办理税务登记的个人：
- 若该个人临时取得收入并需要开具发票，他可以向税务机关申请代开。在这种情况下，如果对方未申请代开发票，虽然不直接构成违法（因为个人可能不了解流程或出于其他原因），但从税务合规的角度来看，您作为付款方有权要求对方提供发票，以确保您的税务处理合规。
从公司作为付款方的责任来看：
- 您公司支付的材料款，如果对应的是应取得发票的情形，而未能取得发票，这将影响您公司企业所得税的税前扣除等税务处理。根据税收规定，未取得合规发票的支出不得在发生年度税前扣除，这可能导致您公司需要承担额外的税负。
建议与措施：
- 在与对方进行交易前，您应明确交易性质，并在合同中明确约定发票的开具要求和责任。
- 如果对方无法提供发票，您应审慎考虑交易风险，或寻求其他合法的支付方式及税务处理方案，如要求对方提供税务机关代开的发票或调整交易结构以符合税务合规要求。
- 您公司应加强内部财务管理和税务培训，提高员工对发票管理重要性的认识，确保每一笔交易都符合税务法规的要求。
综上所述，公司付了材料款对方不开发票是否违法，主要取决于对方是否为依法需要办理税务登记的经营主体以及是否履行了开具发票的义务。为了确保您公司的税务合规和财务安全，建议您在交易过程中严格遵守相关法律法规，并采取必要的措施来防范潜在的法律和财务风险。