在农村建房纠纷中，当涉及到工程造价的争议时，进行工程造价鉴定是一个重要的环节，它主要依据以下法律法规和流程来进行：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国民事诉讼法》

   • 该法第七十九条规定，当事人可以就查明事实的专门性问题向人民法院申请鉴定。在农村建房纠纷中，如果工程造价是一个争议焦点，且需要通过专业鉴定来查明事实，那么当事人有权向人民法院提出鉴定申请。

2. 《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》

   • 该规定第三十条指出，人民法院在审理案件过程中认为待证事实需要通过鉴定意见证明的，应当向当事人释明，并指定提出鉴定申请的期间。这意味着，如果法院认为工程造价的争议需要通过鉴定来解决，它会告知当事人，并给出提出鉴定申请的时间限制。
   • 第三十一条规定，当事人申请鉴定，应当在人民法院指定期间内提出，并预交鉴定费用。逾期不提出申请或者不预交鉴定费用的，视为放弃申请。这强调了当事人提出鉴定申请的时效性和费用预交的要求。
   • 第三十二条说明，人民法院准许鉴定申请的，应当组织双方当事人协商确定具备相应资格的鉴定人。当事人协商不成的，由人民法院指定。这确保了鉴定人的专业性和公正性。

3. 《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》

   • 该解释第三十二条特别针对建设工程施工合同纠纷中的工程造价、质量、修复费用等专门性问题有争议的情况，规定人民法院认为需要鉴定的，应当向负有举证责任的当事人释明。如果当事人经释明未申请鉴定，或虽申请鉴定但未支付鉴定费用、拒不提供相关材料的，应当承担举证不能的法律后果。这进一步明确了在工程造价争议中，当事人提出鉴定申请的责任和后果。

二、处理流程

1. 申请提出：当事人在诉讼过程中，如果认为工程造价存在争议且需要通过专业鉴定来查明事实，可以向人民法院提出鉴定申请。

2. 法院审查：人民法院会对当事人的鉴定申请进行审查，判断其是否符合法定条件，如是否属于专门性问题、是否有必要进行鉴定等。

3. 确定鉴定人：经审查认为需要鉴定的，人民法院会组织双方当事人协商确定具备相应资格的鉴定人。如果协商不成，则由人民法院指定。

4. 鉴定实施：鉴定人接受委托后，会按照规定的程序和方法进行鉴定工作，并出具鉴定意见。

5. 质证与认证：鉴定意见出具后，人民法院会组织双方当事人进行质证。经法庭许可，当事人可以向鉴定人发问。如果鉴定人确因特殊原因无法出庭，需经法庭准许并说明情况。最终，人民法院会根据鉴定意见以及其他证据材料，对案件事实作出认定。

综上所述，农村建房纠纷中的工程造价鉴定是依据一系列法律法规和流程来进行的，旨在确保鉴定的公正性、专业性和合法性。