针对您提出的“建设工程合同价款与实际工程款不符”的问题，以下是我的详细解答：
结论前置：建设工程合同价款与实际工程款不符时，处理方式需根据具体情况而定。若合同经过备案且与实际履行内容不一致，通常以备案合同为准；若未进行招标或备案合同与实际履行合同有实质性差异，则可能以实际履行的合同为依据。
一、合同备案与实际履行不一致的情况
备案合同为结算依据：
- 根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》，如果建设工程合同经过备案，且备案合同与实际施工合同中的结算款不一致，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据。
实际履行合同为结算依据：
- 对于非必须招标的建设工程，如果实际未进行招投标，但双方将签订的施工合同在当地建设行政管理部门进行了备案，且备案合同与实际履行的合同实质性内容不一致，那么应当以当事人实际履行的合同作为结算工程价款的依据。
二、合同金额与实际支付金额不符的处理
原因分析：
- 可能是双方协商变更了合同价款、部分履行或增减项未明确约定、违约扣除或质量标准未达标、付款条件未明确或计算错误、合同变更或解除后未达成一致，或是产生了额外费用。
法律处理方式：
- 双方应首先尝试通过友好协商解决争议，明确金额不符的具体原因，并探讨解决方案。
- 如果协商不成，可以根据合同中的仲裁条款或仲裁协议向仲裁机构申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼。
- 在处理过程中，应保留好与合同履行、金额支付相关的各类证据，并采取相应措施防止类似情况再次发生。
三、实际施工人的权益保护
- 在建设施工合同无效的情况下，如果建设工程经验收合格，实际施工人仍有权参照合同关于工程价款的约定，要求发包人给予折价补偿。
- 实际施工人还可以依法行使代位权，以保障自身债权的实现。
四、建议与注意事项
建议：
- 在签订建设工程合同时，应尽可能明确各项条款和细节，包括工作范围、质量标准、付款条件等。
- 在合同履行过程中，保持沟通并定期核对进度和款项，确保合同金额与实际支付金额一致。
注意事项：
- 如果出现合同价款与实际工程款不符的情况，应及时咨询专业律师，以便依法维护自身权益。
- 注意诉讼时效问题，根据《民法典》，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。
综上所述，建设工程合同价款与实际工程款不符时，应根据具体情况选择适当的处理方式，并依法维护自身权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。