核心结论：骑手受伤未进行工伤认定但与公司自行达成一致的情况下，雇主责任险的赔偿需分情况讨论，主要取决于保险合同约定、自行达成协议的内容以及是否符合保险理赔条件。以下是具体分析：
保险合同约定是关键前提
雇主责任险的赔偿范围、免责条款、理赔流程等均以保险合同为准。若合同明确约定“需以工伤认定为前提”，则未认定工伤可能影响理赔；若合同未作此限制，则公司自行与骑手达成的协议（如赔偿金额、责任划分）可能被保险公司认可。
建议：立即查阅保险合同中“赔偿条件”“责任范围”“免责情形”等条款，重点确认是否要求工伤认定作为理赔必要条件。
公司自行达成协议的效力需符合法律要求
若公司与骑手达成的协议内容合法（如未显失公平、未违反强制性规定），且骑手自愿签署，则该协议对双方具有约束力。保险公司理赔时，可能要求提供协议原件、支付凭证等材料，以核实赔偿金额的合理性。
风险点：若协议金额明显高于或低于实际损失（如未涵盖医疗费、误工费等法定赔偿项目），保险公司可能拒赔或要求调整赔偿金额。
理赔需满足“事故性质符合保险责任”
雇主责任险通常覆盖“在工作过程中因意外事故或职业病导致的员工伤亡”。若骑手受伤符合这一条件（如送餐途中摔倒、交通事故等），即使未认定工伤，保险公司仍可能理赔；但若受伤属于故意行为、醉酒、无证驾驶等免责情形，则会被拒赔。
操作建议：收集事故现场证据（如照片、监控）、医疗记录、警方事故认定书等材料，证明事故与工作相关且无免责情形。
理赔流程需按保险公司要求推进
即使公司已与骑手达成协议，仍需向保险公司报案并提交完整材料（如协议、支付凭证、事故证明、医疗发票等）。保险公司会审核材料并决定是否赔付、赔付金额。若对理赔结果有异议，可通过协商、投诉或诉讼解决。
提醒：切勿自行修改或伪造材料，否则可能面临保险欺诈的法律风险。
总结：雇主责任险能否赔偿，需结合保险合同、协议合法性、事故性质及理赔材料综合判断。建议优先与保险公司沟通，明确理赔要求；若遇纠纷，可进一步向我咨询具体法律策略。