结论：针对别单位非法扣留入职通知书和档案不还的问题，你可以通过协商、投诉或法律途径来维护自己的权益，并可能获得相应的赔偿。具体赔偿方式和金额需根据实际情况和法律规定来确定。
分析说明：
协商解决：
- 首先，你可以尝试与扣留你入职通知书和档案的单位进行协商，要求其立即归还相关文件。在协商过程中，你可以明确表达自己的诉求，并指出对方的行为已经侵犯了你的合法权益。
- 如果协商成功，对方同意归还文件，那么问题就得到了解决。此时，你可以要求对方出具书面确认，以确保自己的权益得到保障。
投诉途径：
- 如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门或相关行业主管部门进行投诉。在投诉时，你需要提供详细的证据，如入职通知书、档案被扣留的证明等，以支持你的诉求。
- 劳动监察部门或相关行业主管部门在接到投诉后，会进行调查核实，并根据调查结果对违法行为进行处罚。如果处罚决定中包括要求对方归还你的入职通知书和档案，并可能给予你一定的赔偿，那么你的权益将得到进一步保障。
法律途径：
- 如果协商和投诉均未能解决问题，你可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。具体来说，你可以向法院提起诉讼，要求对方归还你的入职通知书和档案，并赔偿因此给你造成的损失。
- 在诉讼过程中，你需要提供充分的证据来证明对方的行为已经构成了侵权，并导致了你的损失。法院在审理案件后，会根据事实和法律规定作出判决，要求对方承担相应的法律责任。
赔偿方面：
- 关于赔偿的具体方式和金额，这需要根据实际情况和法律规定来确定。如果因为对方扣留入职通知书和档案导致你无法及时入职或遭受了其他经济损失，你可以要求对方进行赔偿。
- 赔偿的范围可能包括但不限于：因无法入职而损失的工资收入、因处理此事而产生的交通费、住宿费等合理费用，以及因精神损害而要求的赔偿等。具体赔偿金额需要由法院根据案件实际情况和法律规定进行裁决。
行动建议：
- 在处理此类问题时，建议你保持冷静和理性，不要采取过激行为。同时，要积极收集证据，如入职通知书、档案被扣留的证明、与对方的沟通记录等，以支持你的诉求。
- 如果你对法律程序不熟悉或担心自己的权益无法得到充分保障，可以寻求专业律师的帮助。律师可以为你提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助你更好地维护自己的权益。
后续思考依据：
- 在处理此类问题时，你需要关注相关法律法规的变化和更新，以确保自己的诉求符合法律规定。同时，也要关注类似案例的判决结果和司法实践，以便更好地了解自己的权益和可能的赔偿范围。
- 如果你在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况和需求，为你提供专业的法律建议和帮助。