关于公司自离后工资如何结算的问题，这是一个涉及劳动法律法规的重要事项，需要严谨对待。以下是我为您详细梳理的工资结算流程和相关注意事项：
一、工资结算的基本原则
按实际出勤结算：
- 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或无故拖欠。因此，即使员工自动离职，公司也应按照其实际出勤天数或完成的工作量来结算工资。
遵循劳动合同约定：
- 如果劳动合同中有明确约定工资支付方式和条件，公司应优先按照合同约定执行。这有助于确保工资结算的透明度和公正性。
遵守最低工资标准：
- 结算的工资不得低于当地最低工资标准，这是保障劳动者基本生活需求的重要法律底线。
二、工资结算的具体步骤
核对考勤记录：
- 公司应首先确认员工的实际出勤天数或工作时长，这是计算工资的基础依据。
计算应发工资：
- 根据员工的岗位工资、绩效工资、加班费等各项收入，计算出应发工资总额。这包括基本工资、奖金、津贴等所有应得收入。
扣除应扣款项：
- 在应发工资中，需要扣除个人所得税、社保个人缴纳部分、公积金个人缴纳部分等法定应扣款项。此外，如果员工有未归还的公司财物或借款等，公司也可以依据相关规定进行相应扣除，但需确保合法合规，并有明确依据。
确定实发工资：
发放工资：
- 公司应通过银行转账或其他双方约定的方式，及时将实发工资支付给员工。即使员工是自离，公司也应在解除或终止劳动合同时一次性付清工资。
三、特殊情况处理
工作交接未完成：
- 如果员工自动离职前未完成工作交接，公司可以暂不发放工资，直至工作交接完成。但需注意，这种做法必须合法合规，不能以此为由无限期拖延工资发放。公司应书面通知员工相关后果，并保留证据。
经济损失赔偿：
- 如果员工因自动离职给公司造成经济损失，公司有权要求员工赔偿。赔偿金额可从工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
押金退还：
- 如果公司在员工入职时收取了押金，应在员工离职时全额退还，这是公司的法定义务。
四、法律保障与建议
- 遵守法律法规：公司在结算自离员工工资时，必须严格遵守相关法律法规，确保员工的合法权益不受侵害。
- 员工权益维护：员工在离职前应尽可能提交书面辞职申请并办理离职手续，以便公司顺利进行工资结算和社保账户转移。如果员工认为工资结算存在不合理之处，可以通过向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等合法途径维护自身权益。
综上所述，公司自离后的工资结算是一个需要严谨对待的法律问题。公司应遵循相关法律法规和劳动合同约定，确保工资结算的合法性和公正性。同时，员工也应了解自己的权益和义务，积极维护自己的合法权益。