在盗窃电动车电瓶且无直接证据的情况下，司法机关会依据间接证据、犯罪嫌疑人的供述、证人证言、监控录像等综合证据链来认定犯罪事实，并依法进行处理。以下是对此问题的详细分析：
一、法律性质与后果
行政处罚：
- 若盗窃情节较轻，尚不构成犯罪，根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第四十九条，行为人可能面临五日以上十日以下拘留，并可处五百元以下罚款；情节较重的，处十日以上十五日以下拘留，并可处一千元以下罚款。
刑事处罚：
- 若盗窃行为达到一定标准，构成盗窃罪，依据《中华人民共和国刑法》第二百六十四条，将面临不同程度的刑事处罚。具体处罚标准取决于电瓶的价值、盗窃情节以及犯罪嫌疑人的认罪态度等因素。例如，盗窃公私财物价值一千元至三千元以上（具体数额因地区经济发展水平而异）即视为“数额较大”，可处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金。
二、无直接证据时的处理
间接证据的运用：
- 在无直接证据的情况下，司法机关会注重收集和运用间接证据。间接证据虽然不能直接证明犯罪事实，但当多个间接证据相互印证，形成完整的证据链时，同样可以认定犯罪事实。例如，犯罪嫌疑人的指纹、DNA等生物痕迹留在现场，或者犯罪嫌疑人的行踪轨迹与盗窃时间、地点相吻合等。
犯罪嫌疑人的供述与辩解：
- 犯罪嫌疑人的供述和辩解也是重要的证据来源。如果犯罪嫌疑人能够如实供述自己的犯罪事实，或者提供有利于自己的辩解，司法机关会结合其他证据进行综合判断。但需要注意的是，犯罪嫌疑人的供述和辩解必须真实可靠，且与其他证据相互印证，才能作为定案的依据。
证人证言与监控录像：
- 证人证言和监控录像也是重要的证据形式。如果现场有目击者或者附近有监控摄像头，司法机关会积极收集这些证据，以证明犯罪嫌疑人的犯罪事实。证人证言需要证人出庭作证，并接受质证；监控录像则需要经过鉴定，确认其真实性和完整性。
三、法律建议
积极配合调查：
- 如果涉嫌盗窃电动车电瓶，建议积极配合司法机关的调查工作，如实陈述事实，提供有利于自己的证据和线索。这有助于司法机关查明事实真相，依法作出公正的处理。
寻求法律援助：
- 如果对法律程序不熟悉或者担心自己的权益受到侵害，可以寻求专业的法律援助。作为专业律师，我可以为你提供法律咨询和辩护服务，帮助你维护自己的合法权益。
增强法律意识：
- 无论是否构成犯罪，盗窃行为都是不可取的。它侵犯了他人的财产权，破坏了社会秩序。因此，建议公众增强法律意识，遵守法律法规，不从事任何违法犯罪活动。
综上所述，盗窃电动车电瓶无直接证据时，司法机关会依据间接证据、犯罪嫌疑人的供述、证人证言、监控录像等综合证据链来认定犯罪事实，并依法进行处理。如果你或他人涉嫌此类犯罪，建议积极配合调查，寻求法律援助，并增强法律意识。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。