合同可以生效，但中标费率条款的效力及履行可能存在争议，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、合同生效的一般条件
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同生效的一般条件包括：
- 行为人具有相应的民事行为能力：即签约双方需具备签订合同的法律资格，如自然人需具备完全民事行为能力，法人或其他组织需具备相应的民事权利能力和民事行为能力。
- 意思表示真实：合同内容需是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：合同内容需合法合规，不得违反国家法律法规的强制性规定，也不得违背社会公德和公共秩序。
在您描述的情况下，若签约合同满足上述条件，即使合同中未体现基准结算费率，但中标通知书中有体现中标费率，合同本身仍然可以生效。
二、中标费率条款的效力及履行争议
中标费率条款的效力：
- 中标通知书是招标人向中标人发出的，表明其已接受中标人的投标，并愿意与其签订合同的书面通知。中标通知书中的中标费率，通常被视为双方对合同价款或结算方式的约定。
- 若合同中未明确约定基准结算费率，但中标通知书中有明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么中标费率条款应视为有效。双方应按照中标通知书中的约定履行合同。
履行争议的处理：
- 若在合同履行过程中，双方因基准结算费率产生争议，首先应尝试通过协商解决。协商不成的，可以依据合同中的争议解决条款（如仲裁条款或诉讼条款）寻求法律救济。
- 在处理此类争议时，法院或仲裁机构可能会综合考虑中标通知书、合同内容、双方交易习惯、行业惯例以及公平原则等因素，来确定最终的结算费率。
三、建议
- 完善合同条款：为避免类似争议的发生，建议在签订合同时，明确约定基准结算费率或其他与价款、结算相关的条款。这样可以在合同履行过程中减少不必要的纠纷。
- 保留相关证据：在合同履行过程中，双方应妥善保管与合同相关的所有证据，包括中标通知书、合同文本、往来函件、支付凭证等。这些证据在处理争议时将起到至关重要的作用。
- 及时寻求法律帮助：若双方在合同履行过程中产生争议，且无法通过协商解决，建议及时寻求专业律师的法律帮助。律师可以根据具体情况，为双方提供法律意见和解决方案。
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