以民事调解书形式达成的以物抵债协议在符合一定条件下可以对抗执行，但并非绝对。以下是对此问题的详细分析：
一、以物抵债协议的基本性质与效力
以物抵债协议是一种债务清偿方式，即债务人通过转让其财产给债权人来清偿债务。当这种协议以民事调解书的形式确认时，它便具有了法律上的强制执行力。然而，这种执行力并不意味着协议中的财产可以自动排除法院的强制执行。是否能够对抗执行，还需根据协议的具体履行情况、物权变动情况以及相关法律规定进行综合判断。
二、对抗执行的条件
协议真实有效：
- 以物抵债协议必须是双方当事人的真实意思表示，且不存在欺诈、胁迫等情形。
- 协议的内容必须合法，不违反法律法规的强制性规定。
物权变动完成：
- 对于不动产，如房屋，需完成过户登记手续，将所有权转移至债权人名下。
- 对于动产，如汽车，需完成交付手续，使债权人实际占有该财产。
- 若物权变动未完成，则抵债物的所有权仍属于原债务人，债权人难以仅凭协议对抗执行。
无其他权利人主张权利：
- 在以物抵债协议履行过程中，不存在其他权利人对该财产主张权利的情况。
- 若存在其他权利人主张权利，如抵押权人、质押权人等，则可能引发新的法律纠纷，影响以物抵债协议的履行和对抗执行的效果。
符合法律规定的例外情形：
- 根据相关法律法规的规定，存在一些例外情形可以排除强制执行。例如，在某些情况下，即使财产未办理过户登记手续，但如果债权人已经支付了全部价款并实际占有该财产，且未办理过户登记的原因非因其自身过错所致，那么债权人可以请求法院解除对该财产的查封、扣押、冻结措施。
三、实践中的注意事项
及时办理过户登记：
- 为了避免不必要的法律纠纷和风险，建议债权人在达成以物抵债协议后尽快办理过户登记手续。
- 这样不仅可以完善权利转移的法律程序，还可以增强对抗第三人的法律效力。
保留相关证据：
- 在履行以物抵债协议的过程中，债权人应妥善保留相关证据材料，如协议文本、付款凭证、占有证明等。
- 这些证据材料在后续可能发生的法律纠纷中将起到至关重要的作用。
关注法律规定的变化：
- 由于法律法规的不断更新和完善，建议债权人在处理以物抵债协议相关问题时密切关注法律规定的变化情况。
- 及时调整自己的行为和策略，以确保自己的权益得到充分保护。
四、案例分析
假设甲与乙签订了一份以房抵债协议，约定甲将其名下的一套房屋抵债给乙，但未办理过户登记手续。后来，甲的其他债权人丙申请法院执行该房屋。在此情况下，乙仅凭以房抵债协议难以阻止法院的执行行为。因为房屋的所有权仍属于甲，乙尚未取得房屋的所有权。然而，如果乙在协议签订后尽快办理了过户登记手续，将房屋所有权转移至自己名下，那么乙就可以基于物权优先于债权的原则，对抗丙对该房屋的执行申请。
总结与建议：以民事调解书形式达成的以物抵债协议能否对抗执行，取决于协议的合法性、有效性、物权变动的完成情况以及是否存在其他权利人主张权利等因素。如果您面临类似问题，建议直接向我咨询，以便根据您的具体情况提供更详细的法律建议。