加班调休本身不会直接导致奖金被扣，但具体是否扣奖金需依据公司规章制度及劳动合同约定来判断。以下从不同角度进行分析：
一、加班调休与奖金的直接关系
加班调休是用人单位因生产经营需要，安排劳动者在正常工作时间以外工作后，给予劳动者相应休息时间的补偿方式。而奖金则是用人单位根据劳动者的工作表现、业绩或公司盈利情况等因素，额外支付给劳动者的报酬。从性质上看，加班调休与奖金并无直接关联，加班调休本身并不构成扣奖金的合法理由。
二、公司规章制度及劳动合同的约定
公司规章制度：
- 如果公司规章制度中明确规定了加班调休与奖金的挂钩关系，例如“员工在调休期间视为未出勤，不享受当月奖金”等类似条款，且该规章制度已经过民主程序制定并公示，那么公司可能依据此规定扣减奖金。但需注意，此类规定不得违反法律法规的强制性规定，否则可能被认定为无效。
劳动合同约定：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了加班调休与奖金的关系，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方应按照合同约定履行。但同样，如果合同约定违反了法律法规的强制性规定，该约定也可能被认定为无效。
三、法律法规的强制性规定
加班的法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要加班，需与工会和劳动者协商，且一般每日不得超过一小时；特殊情况下延长工作时间每日不得超过三小时，每月不得超过三十六小时。这表明加班应基于自愿和协商的原则，且加班时间受到严格限制。
工资支付的法律规定：
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条明确规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。奖金作为工资的一部分，同样受到此规定的保护。
- 《工资支付暂行规定》第十五条也列出了可代扣工资的情况，但加班调休并不在此列。因此，公司不得以加班调休为由扣减奖金。
四、建议与措施
查阅公司规章制度及劳动合同：
- 劳动者应首先查阅公司规章制度及劳动合同，了解其中关于加班调休与奖金的约定。如果发现公司规章制度或劳动合同中的规定违反了法律法规的强制性规定，劳动者有权向公司提出异议，并要求公司改正。
与公司沟通协商：
- 如果公司确实以加班调休为由扣减了奖金，劳动者可以尝试与公司沟通协商，了解扣减奖金的具体原因，并表达自己的观点和诉求。在沟通过程中，劳动者应保留好相关证据，如工资条、考勤记录、公司通知等。
寻求法律援助：
- 如果与公司沟通协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，由其进行调查处理。同时，劳动者也可以依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，向劳动争议调解组织申请调解，或直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁结果不满意时，劳动者还可以在规定时间内向人民法院提起诉讼。
总结：加班调休本身不会直接导致奖金被扣，但具体是否扣奖金需依据公司规章制度及劳动合同约定来判断。如果公司规章制度或劳动合同中的规定违反了法律法规的强制性规定，劳动者有权向公司提出异议，并要求公司改正。在面对不合理的扣薪行为时，劳动者应积极运用法律武器来保护自己。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。