核心前提：员工因腰椎间盘突出（腰突）旷工，涉及员工与用人单位之间的劳动权益及赔偿问题。

结论与详细分析：

1. 腰突是否构成旷工的合法理由：

   • 腰突本身并不直接构成旷工的合法理由。员工若因腰突需要治疗或休息，应按照公司规章制度及劳动法规定，提前申请病假或医疗期，并提供相应的医疗证明。
   • 若员工未经批准擅自离岗，即构成旷工，用人单位有权根据公司规章制度进行处理，包括但不限于警告、扣发工资、解除劳动合同等。

2. 旷工期间的工资与赔偿：

   • 工资扣除：根据《工资支付暂行规定》，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。但旷工本身并不直接等同于给用人单位造成经济损失，除非因旷工导致公司实际损失（如项目延误、客户流失等），且能证明该损失与旷工有直接因果关系。
   • 赔偿问题：若员工旷工行为严重违反公司规章制度，用人单位有权解除劳动合同，且通常无需支付经济补偿。但若用人单位以此为由解除劳动合同，需确保规章制度合法、合理，且已向员工公示或告知。若员工认为解除行为违法，可申请劳动仲裁，要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金。

3. 腰突员工的特殊保护：

   • 若腰突被认定为职业病或工伤，员工享有相应的工伤保险待遇，包括医疗费、停工留薪期工资、伤残补助等。此时，旷工问题可能因工伤待遇的享受而得到一定程度的缓解或免除。
   • 若腰突虽未被认定为职业病或工伤，但员工确实因病情严重无法工作，可依据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》享受医疗期，医疗期内用人单位不得解除劳动合同，且需支付病假工资或疾病救济费。

4. 建议与行动指南：

   • 员工方面：若因腰突需要休息或治疗，应及时向公司申请病假或医疗期，并提供医疗证明。若公司拒绝或未按规定处理，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   • 用人单位方面：应完善规章制度，明确旷工的定义、处理流程及后果。在处理旷工员工时，需确保程序合法、证据充分，避免违法解除劳动合同的风险。同时，对于腰突等特殊病情的员工，应给予必要的关怀和支持，体现企业的人文关怀。

总结：腰突员工旷工的赔偿问题需根据具体情况分析，包括旷工的合法性、是否给公司造成损失、腰突是否构成工伤或职业病等。员工和用人单位均应依法行事，维护自身合法权益。如有具体法律问题，可直接向我咨询。