关于“镇里根据医保完成率扣绩效是否合法”的问题，这需要从法律、政策以及实际操作三个层面来综合分析。

首先，从法律层面来看：

医保缴纳通常遵循自愿原则，这是基于公民的基本权利和自由选择。如果镇里以强制手段要求居民参保，并以此作为考核绩效的依据，甚至进行扣罚，这可能涉嫌违反相关法律法规中关于公民权利保护和自愿参保的规定。特别是当这种扣罚行为没有明确的法律依据或地方性法规支持时，其合法性就值得商榷。

其次，从政策层面来看：

医保政策旨在保障公民的基本医疗需求，提高医疗保障水平。政策的实施应当注重公平、公正和可持续性，避免给基层工作人员和居民带来不必要的负担。如果镇里将医保完成率与绩效挂钩，并采取扣罚措施，这可能会扭曲政策的初衷，导致基层工作人员为了完成任务而采取不当手段，如强制参保、垫付费用等，这不仅损害了居民的权益，也影响了政策的执行效果。

最后，从实际操作层面来看：

根据您提供的参考信息，一些地方确实存在以医保完成率来考核基层工作人员的情况，甚至出现了形式主义的问题，如“未完成任务前24:00不得下班”等。这些做法不仅增加了基层工作人员的负担，也引发了不少争议和质疑。实际上，医保缴纳工作应当注重宣传引导和服务质量，通过提高居民对医保政策的认知度和满意度来推动参保率的提升，而不是简单地以完成率来考核和扣罚。

综合以上分析：

镇里根据医保完成率扣绩效的做法，在缺乏明确法律依据或地方性法规支持的情况下，其合法性是存疑的。更重要的是，这种做法可能扭曲医保政策的初衷，增加基层工作人员的负担，损害居民的权益。因此，建议镇里在推动医保参保工作时，应当注重宣传引导和服务质量，遵循自愿原则，避免采取强制或不当手段。同时，也建议上级部门加强对基层工作的指导和监督，确保医保政策的顺利实施和居民的合法权益得到保障。